Identificação e mapeamento de genes associados a mecanismos de fitopatogenicidade de Crinipellis perniciosa através da obtenção de ESTs

• Processo: 02/09280-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2006
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira
• Beneficiário: Johana Rincones Pérez
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Fitopatógenos Vassoura-de-bruxa Etiquetas de sequências expressas Análise de sequência de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cacau | Ests | Fitopatogenicidade | Genoma | Mapeamento Fisico | Vassoura-De-Bruxa

Resumo

Apesar da grande importância econômica de C. perniciosa, muito pouco se conhece sobre os genes envolvidos na sua fitopatogenicidade. O objetivo deste projeto é a identificação de genes de C. perniciosa expressos na presença de extratos do hospedeiro através da obtenção de ESTs. O RNA mensageiro será extraído a partir de micélio do fungo cultivado na ausência e presença de extratos de plantas de cacau e será realizada uma hibridização subtrativa para construir uma biblioteca de cDNA enriquecida com seqüências induzidas. 5000 clones desta biblioteca serão seqüenciados para produzir ESTs, estas seqüências serão comparadas com as bases de dados públicas. Alinhamentos entre as seqüências dos ESTs e as seqüências genômicas obtidas pelo Projeto Genoma de C. perniciosa permitirão a identificação de introns e exons. Adicionalmente, alguns ESTs de interesse serão mapeados a seus respectivos cromossomos utilizando como sondas os cromossomos eluídos de géis de eletroforese em gel de campo pulsado. Outros ESTs serão utilizados para seqüênciar totalmente a região codante (ORF) do gene que representam. As regiões upstream e downstream serão obtidas por comparação com os dados genômicos com o objeto de identificar regiões regulatórias. Os conhecimentos gerados por este projeto podem auxiliar no entendimento dos mecanismos de instalação da doença, permitindo o desenvolvimento de novos métodos de controle para este importante fungo fitopatogênico. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RINCONES‚ J.; MAZOTTI‚ G.D.; GRIFFITH‚ G.W.; POMELA‚ A.; FIGUEIRA‚ A.; LEAL‚ G.A.; QUEIROZ‚ M.V.; PEREIRA‚ J.F.; AZEVEDO‚ R.A.; PEREIRA‚ G.A.G.; et al. Genetic variability and chromosome-length polymorphisms of the witches’ broom pathogen Crinipellis perniciosa from various plant hosts in South America. MYCOLOGICAL RESEARCH, v. 110, n. 7, p. 821-832, 2006. (00/10545-4, 02/09280-1)

FORMIGHIERI, EDUARDO F.; TIBURCIO, RICARDO A.; ARMAS, EDUARDO D.; MEDRANO, FRANCISCO J.; SHIMO, HUGO; CARELS, NICOLAS; GOES-NETO, ARISTOTELES; COTOMACCI, CAROLINA; CARAZZOLLE, MARCELO F.; SARDINHA-PINTO, NAIARA; et al. The mitochondrial genome of the phytopathogenic basidiomycete Moniliophthora perniciosa is 109 kb in size and contains a stable integrated plasmid. MYCOLOGICAL RESEARCH, v. 112, n. 10, p. 1136-1152, OCT 2008. (02/09280-1)

RINCONES‚ J.; SCARPARI‚ L.M.; CARAZZOLLE‚ M.F.; MONDEGO‚ J.M.C.; FORMIGHIERI‚ E.F.; BARAU‚ J.G.; COSTA‚ G.G.L.; CARRARO‚ D.M.; BRENTANI‚ H.P.; VILAS-BOAS‚ L.A.; et al. Differential gene expression between the biotrophic-like and saprotrophic mycelia of the witches’ broom pathogen Moniliophthora perniciosa. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, v. 21, n. 7, p. 891-908, 2008. (05/60432-5, 02/09280-1)

FORMIGHIERI, EDUARDO F.; TIBURCIO, RICARDO A.; ARMAS, EDUARDO D.; MEDRANO, FRANCISCO J.; SHIMO, HUGO; CARELS, NICOLAS; GOES-NETO, ARISTOTELES; COTOMACCI, CAROLINA; CARAZZOLLE, MARCELO F.; SARDINHA-PINTO, NAIARA; et al. The mitochondrial genome of the phytopathogenic basidiomycete Moniliophthora perniciosa is 109 kb in size and contains a stable integrated plasmid. MYCOLOGICAL RESEARCH, v. 112, p. 17-pg., 2008-10-01. (02/09280-1)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

PÉREZ, Johana Rincones. Vassoura-de-bruxa: organização genomica, variabilidade de isolados e analise da identidade e expressão de genes ligados a patogenicidade do fungo Crinipellis perniciosa. 2006. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.