Simulação da evolução molecular do HIV-1

• Processo: 99/10515-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2000
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2002
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Paolo Marinho de Andrade Zanotto
• Beneficiário: Leonardo de Oliveira Martins
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genes Biotecnologia Seleção natural Algoritmos genéticos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Algoritmos Geneticos | Biotecnologia | Diversidade Viral | Genes | Selecao Natural | Simulacao

Resumo

Este projeto visa, além do estudo de sistemas evolutivos a nível genérico, a elaboração de hipóteses nulas para análise de dados de seqüências de nucleotídeos obtidos em laboratório. Ele se baseia na construção de uma biblioteca de algoritmos para a simulação da evolução molecular do HIV-1. Através de simulação estocástica, um gene (representado por sua composição primária de bases) evoluirá, segundo um modelo mutacional cujos parâmetros são compatíveis com valores obtidos na literatura sobre o HIV. Estimativas da diversidade genética resultante da simulação podem então ser confrontadas com valores obtidos experimentalmente. (AU)