Análise do transcriptoma associado a lincRNAs no sistema olfativo acessório

Autor(es)

Antônio Pedro Camargo

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia
• Data de defesa: 2018-02-22

Membros da banca

Fabio Papes; Benilton de Sá Carvalho; Jörg Kobarg

• Orientador: Fabio Papes

Resumo

O sistema olfatório é um sistema sensorial capaz de detectar sinais químicos ambientais, iniciando a sensação de odor e/ou mudanças comportamentais e endócrinas. Esse sistema é composto por dois órgãos olfatórios, o epitélio olfatório principal (MOE) e o órgão vomeronasal (VNO), que exibem um processo único e altamente coordenado de regulação da expressão gênica. Recentemente, uma variedade de longos RNAs não codificantes (lncRNAs) foi identificada atuando na regulação da expressão gênica. Dadas as propriedades moleculares da expressão gênica nos tecidos olfatórios, hipotetizou-se que os lncRNAs podem estar envolvidos na neurogênese nesses órgãos. Um identificador de lncRNAs foi desenvolvido utilizando um algoritmo moderno de aprendizado de máquina e foi empregado na identificação de novos lncRNAs intergênicos (lincRNAs) no transcriptoma de camundongo. Utilizando dados de expressão, vários desses transcritos foram identificados como específicos dos órgãos olfatórios, e muitos diferencialmente expressos entre camundongos adultos e recém-nascidos. Com dados de RNA-Seq de células únicas do MOE, foram detectados lincRNAs que exibem um perfil de expressão definido ao longo da neurogênese. Além disso, análises de coexpressão gênica e de enriquecimento de termos de gene ontology (GO) foram aplicadas para inferir possíveis papéis biológicos para alguns dos lincRNAs. Por fim, a expressão de alguns lincRNAs candidatos foi validada por RT-PCR e hibridação in situ. Esses resultados representam a primeira iniciativa de pesquisa da expressão de lncRNAs na interface sensorial do MOE e VNO. Este trabalho fornece base para investigações subsequentes dos mecanismos moleculares e papéis funcionais dos lincRNAs no sistema olfatório (AU)

• Processo FAPESP: 16/05379-6 - Análise do transcritoma associado a lincRNAs no sistema olfativo acessório
• Beneficiário: Antônio Pedro de Castello Branco da Rocha Camargo
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado