Texto completo
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| Autor(es): |
Jonas Weissmann Gaiarsa
Número total de Autores: 1
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| Tipo de documento: | Tese de Doutorado |
| Imprenta: | São Paulo. |
| Instituição: | Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Ciências Biomédicas (ICB/SDI) |
| Data de defesa: | 2013-07-30 |
| Membros da banca: |
Marie Anne van Sluys;
Marcos Silveira Buckeridge;
Shaker Chuck Farah;
Paulo Lee Ho;
Marilis do Valle Marques
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| Orientador: | Marie Anne van Sluys |
| Resumo | |
O presente trabalho visa compreender o processo de degradação da parede celular vegetal de hospedeiros de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae. Criamos e aperfeiçoamos uma técnica de enumeração dos genes relacionados ao metabolismo de polissacarídeos, com enfoque na distinção entre aqueles que agem sobre os componentes da parede celular vegetal e sobre outros polissacarídeos. A história evolutiva desse conjunto de enzimas foi delineada através de inferências sobre as relações de homologia entre os genes enumerados, sua presença ou ausência nos diversos genomas abordados e comparação das taxas de mutação entre grupos de homólogos. Além disso, procuramos também, com essa etapa de bioinformática e a etapa seguinte, incrementar a anotação desses genes, muitos descritos como hipotéticos ou com vaga definição de sua função. Na segunda parte do desenvolvimento do projeto foram feitos experimentos de expressão heteróloga e verificação da atividade enzimática para validação da anotação de alguns dos genes identificados. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 10/50735-9 - História evolutiva e caracterização molecular de depolimerases ligno-celulósicas de Xanthomonas oryzae |
| Beneficiário: | Jonas Weissmann Gaiarsa |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |