Descoberta e estudos de biossíntese de peptídeos não-ribossomais envolvidos na motilidade de Pseudovibrio brasiliensis Ab134

Autor(es)

Laura Pavan Ióca

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Carlos.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química de São Carlos (IQSC/BT)
• Data de defesa: 2020-12-16

Membros da banca

Roberto Gomes de Souza Berlinck; Alessandra da Silva Eustaquio; Lívia Soman de Medeiros; Monica Tallarico Pupo

• Orientador: Roberto Gomes de Souza Berlinck

Resumo

Neste trabalho foram investigados metabólitos envolvidos na motilidade da α-Proteobactéria marinha Pseudovibrio brasiliensis Ab134, utilizando-se dados de sequenciamento do genoma, experimentos de inativação gênica e técnicas de cultivo em laboratório. O uso de análises de bioinformática permitiu identificar um gene cluster de biossíntese mista de peptídeo não-ribossomal sintetases e policetídeo sintase conservado em linhagens de Pseudovibrio spp. e Pseudomonas spp.. A inativação de genes por recombinação homóloga em P. brasiliensis Ab134, levou a descoberta dos heptapeptídeos pseudovibriamidas A1-6 e dos depsipeptídeos pseudovibriamidas B1-6, codificados por esse gene cluster. Estes compostos apresentam uma conexão via uma ureia, ao invés da uma ligação peptídica conectando os primeiros dois resíduos de aminoácidos. Outras modificações incluem um resíduo de ácido desidroaminobutírico, e um heterociclo tiazol. Bioensaios de motilidade mostraram que o mutante pppA, o qual não produz nenhum dos compostos, tem sua habilidade de swarm reduzida e formação de biofilme aumentada. Já os mutantes pppD, produtores apenas das pseudovibriamidas A, mantiveram sua habilidade de swarm, porém a formação de biofilme foi reduzida. Estes experimentos indicaram que os peptídeos produzidos por P. brasiliensis Ab134 podem atuar nos fenótipos relacionados à colonização de seu hospedeiro, a esponja marinha Arenosclera brasiliensis. (AU)

• Processo FAPESP: 16/05133-7 - Estudo do metabolismo de micro-organismos do ambiente marinho: perfil químico e biossíntese
• Beneficiário: Laura Pavan Ióca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado