Caracterização da expressão genica de celulas tumorais de pacientes com adenocarcinoma esporadico do colon

Autor(es)

Helvia Nascimento

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: Campinas, SP.
• Instituição: Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Faculdade de Ciências Médicas
• Data de defesa: 2007-02-28

Membros da banca

Carmen Silvia Passos Lima; Benedito Mauro Rossi; Andre Luiz Vettore; João Jose Fagundes; José Vassallo

• Orientador: Carmen Silvia Passos Lima; Fernando Ferreira Costa

Resumo

Os mecanismos moleculares envolvidos na origem do adenocarcinoma de cólon esporádico (ACE) ainda não estão completamente elucidados. Recentemente, o método da análise seriada da expressão gênica (SAGE) foi descrito como eficaz para identificar a expressão total de genes de tipos celulares diversos, mas esta análise não foi realizada em células epiteliais purificadas do ACE moderadamente diferenciado. Nós caracterizamos pelo método SAGE a expressão gênica total de células epiteliais neoplásicas do cólon de um paciente com ACE moderadamente diferenciado (SAGE CC) e de células epiteliais normais do cólon de um paciente com megacólon chagásico (SAGE CN). Foram geradas, após o seqüenciamento automático, 44.004 e 43.570 tags totais das bibliotecas SAGE CC e SAGE CN, representando 16.484 e 13.479 tags únicas, respectivamente. Na comparação entre as bibliotecas, 171 transcritos diferencialmente expressos foram identificados (P< 0,001; expressão diferencial = 5), incluindo 10% de transcritos que podem representar genes não descritos. As expressões de 10 genes diferencialmente expressos foram quantificadas pela reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) na amostra de células epiteliais neoplásicas (SAGE CC), com o intuito de validar os resultados obtidos pelo SAGE, e, posteriormente, em amostras de células epiteliais de outros cinco pacientes com o mesmo tipo de doença. As expressões foram concordantes em 80% dos genes (CEACAM6, KLK6, LYZ, PFN1, S100A8, S100A9, VIL2 e ZFHX1B) e discordantes nos demais 20% (PLA1A e ZNF277). As expressões dos genes de interesse, quantificadas pelos dois métodos, foram similares na amostra SAGE CC e nas amostras dos demais pacientes com a doença. Foram observadas expressões anormais de genes envolvidos com a proliferação e diferenciação celular e com a resposta ao stress em células epiteliais neoplásicas. Foram também visualizadas expressões anormais de genes não relacionados com a doença e de genes ainda não identificados. Em conjunto, os nossos resultados podem contribuir para a identificação de genes relacionados com a origem ou a progressão do ACE moderadamente diferenciado e, ainda, para a descoberta de agentes terapêuticos específicos que controlem a proliferação anormal das células neoplásicas. (AU)

• Processo FAPESP: 03/01459-5 - Caracterização da expressão gênica de células tumorais de pacientes com adenocarcinoma colorretal esporádico
• Beneficiário: Helvia Nascimento de Oliveira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado