Texto completo
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| Autor(es): |
Marcelo Cezar Pinto
Número total de Autores: 1
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| Tipo de documento: | Dissertação de Mestrado |
| Imprenta: | Campinas, SP. |
| Instituição: | Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação |
| Data de defesa: | 2002-12-03 |
| Membros da banca: |
João Meidanis;
José Coelho de Pina Junior;
João Carlos Setubal
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| Orientador: | João Meidanis |
| Resumo | |
Desde 1953, quando Natson e Crick desvendaram a estrutura do DNA (ácido desoxirribonucleico), a área de Biologia Molecular tem avançado rapidamente. Técnicas que permitem a manipulação de biomoléculas foram criadas e aperfeiçoadas desde então, gerando enormes quantidades de dados. A necessidade de processar estas informações criou um novo campo chamado de Biologia Molecular Computacional, o qual consiste em desenvolver e usar técnicas matemáticas e de computação para ajudar a resolver problemas de Biologia Molecular. Existem problemas desta área relacionados a Comparação de Genomas, que consiste, a grosso modo, em analisar e comparar seqüências de ácidos nucléicos ou aminoácidos entre espécies. A comparação de genomas busca desvendar as relações existentes entre diferentes espécies. A descoberta de genes ou porções semelhantes nos genomas pode indicar proximidade evolutiva ou regiões indispensáveis à existência da vida. Por outro lado, as diferenças podem relacionar o comportamento particular de uma espécie com uma determinada região de seu genoma. Diante destas observações, iniciamos o desenvolvimento de um algoritmo que realiza a comparação sintática de genomas baseado nos trabalhos de Li e colegas, que utilizam a Complexidade de Kolmogorov para medir a distância entre dois genomas. Ao invés de uma medida de distância, o algoritmo proposto indica as regiões similares entre genomas que são consideradas relevantes pelo critério da Complexidade Condicional de Kolmogorov (AU) | |
| Processo FAPESP: | 00/04776-3 - Métodos e ferramentas para comparação dos genomas Xylella fastidiosa e Xanthomonas axonopodis pv. citri |
| Beneficiário: | Marcelo Cezar Pinto |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |