Modelagem quântica de inibidores enzimáticos.

Autor(es)

Daniel Rodrigo Ferreira Trzesniak

• Tipo de documento: Dissertação de Mestrado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física (IF/SBI)
• Data de defesa: 2002-04-23

Membros da banca

Sylvio Roberto Accioly Canuto; Rogério Custódio; Maria Teresa Lamy Freund

• Orientador: Sylvio Roberto Accioly Canuto

Resumo

Realizamos uma caracterização estrutural e eletrônica dos inibidores enzimáticos E-64 e CA030 utilizando técnicas de química quântica. Otimizações de geometria são realizadas em nível ab initio com os métodos Hartree-Fock e Teoria do Funcional da Densidade e estas estruturas são então comparadas com os resultados cristalográficos obtidos do Protein Data Bank. O cálculo do espectro de vibração infravermelho foi realizado para assegurar que as estruturas eram pontos de mínimo. Nós também fizemos a atribuição das freqüências vibracionais aos grupos funcionais das moléculas. A caracterização eletrônica é obtida com o cálculo do espectro de absorção ultravioleta-visível. Efeitos de solvente são contabilizados através da teoria de Campo de Reação Auto-Consistente. Uma análise detalhada das excitações do espectro calculado do E-64 e do CA030 é realizada e nós estudamos particularmente as transições características em torno de 200 nm. Tanto para o E-64 como para o CA030 nós identificamos o cromóforo responsável pela transição característica dos inibidores. Adicionalmente, nós levamos em consideração a influência da interação do CA030 com a catepsina B através do cálculo do espectro ultravioleta-visível do inibidor com o aminoácido cisteína. (AU)

• Processo FAPESP: 99/12322-3 - Propriedades eletronicas de um inibidor enzimatico e sua interacao com a enzima.
• Beneficiário: Daniel Rodrigo Ferreira Trzesniak
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado