CV Lattes
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Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP) (Instituição Sede da última proposta de pesquisa) País de origem: Brasil
Possui graduação em Ciências de Computação (2011) e mestrado em Ciências da Computação e Matemática Computacional (2013) pela Universidade de São Paulo, e doutorado em Ciência da Computação (2017) pela Universidade Estadual de Campinas. Realizou pós-doutorado (2019) na Universidade de São Paulo. Atualmente é professor da Universidade Federal de Uberlândia (UFU) e participa do Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação da UFU. Tem interesse em problemas que envolvem algoritmos e estruturas de dados compactas com aplicações em Biologia Computacional, Recuperação de Informação e Compressão de Dados. (Fonte: Currículo Lattes)
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A ordenação de sufixos é um problema fundamental em processamento de cadeias de caracteres presente em muitas aplicações de Bioinformática, Recuperação de informação e Mineração de textos. Esse problema está relacionado com a construção do vetor de sufixos e com a transformada de Burrows-Wheeler, os quais desempenham um papel importante em métodos de indexação de cadeias (e.g. FM-índice) …
Com o avanço tecnológico, a quantidade de dados biológicos (ou seja, sequências de DNA e de proteínas) coletados, armazenados em bancos de dados biológicos (BDBs) e disponíveis para análise tem aumentado exponencialmente. Desde que diversos avanços na medicina têm sido obtidos por meio de pesquisa por similaridade em sequências biológicas, surge o desafio de pesquisar eficientemente esses…
Está sendo desenvolvido pelo grupo de pesquisa liderado pela orientadora deste projeto de iniciação científica o Perseus, uma nova técnica baseada em árvores de sufixo voltada à indexação de seqüencias de nucleotídeos. Perseus introduz os seguintes diferenciais: (i) estratégia de três passos: uma abordagem que garante a construção de árvores de sufixo persistentes cujos tamanhos podem exc…
O projeto de pós-doutorado desenvolvido pelo candidato investiga algoritmos para calcular a Transformada de Burrows-Wheeler (BWT), e medidas de similaridade entre textos baseadas na BWT. Recentemente, Egidi, Louza, Manzini e Telles [7] introduziram um algoritmo para calcular em memória externa a BWT o vetor LCP para conjuntos de textos, e descreveram como calcular o vetor de documentos (D…
O projeto de mestrado conduzido pelo candidato trata algoritmos de construção e consulta em vetores de sufixo em memória externa. Vetores de sufixo tem sido utilizado em diferentes problemas de bioinformática. Recentemente Simpson e Durbin (2012) propuseram o uso de vetores de sufixo para montagem de genomas. Entretanto, a quantidade de memória interna exigida pelos algoritmos propostos i…
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