| Processo: | 08/05181-5 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de junho de 2009 |
| Data de Término da vigência: | 31 de julho de 2012 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas |
| Pesquisador responsável: | Richard John Ward |
| Beneficiário: | Carla Botelho Machado |
| Instituição Sede: | Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil |
| Assunto(s): | Engenharia de proteínas Atividade catalítica |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Atividade catalítica | Caracterizacao biofisica | Exocelulases | Expressao e purificacao de proteina heterologa | Rastreamento de bibliotecas de DNA ambiental | Engenharia de Proteínas |
Resumo A aplicação de enzimas em processos industriais tem crescido consideravelmente nas últimas décadas. Os benefícios do uso de enzimas incluem a eliminação de temperaturas altas, solventes orgânicos e extremos de pH, e ao mesmo tempo oferecem um aumento na especificidade e pureza do produto gerado. Uma das aplicações é a conversão da biomassa como uma fonte renovável, como a produção do bioetanol. A biomassa vegetal é composta principalmente por lignocelulose, e uma das enzimas necessárias para hidrólise da celulose é a celulase também denominada de glucanase, que resulta na produção de açúcares redutores que subsequentemente podem ser fermentados em etanol.O objetivo deste projeto é buscar novas exoglucanases provenientes de amostras ambientais que sejam cataliticamente eficientes em pHs ácidos (pH 4-5), e que sejam termoestáveis (temperatura ótima 45-55oC). A bioprospecção das celulases será feita por uma análise metagenômica, que envolve o rastreamento de uma biblioteca do DNA total proveniente de uma comunidade microbiana encontrada em um determinado ambiente. As amostras ambientais serão coletadas e enriquecidas na coluna de Winosgradsky com a adição de bagaço de cana-de-açúcar como fonte de celulose. Usando uma estratégia inovadora que envolve a amplificação por PCR usando iniciadores específicos para a região promotora dos genes procarióticos, será gerada uma biblioteca de DNA ambiental contendo apenas as sequências codificadoras das proteínas. O rastreamento desta biblioteca será feito utilizando o ensaio colorimétrico do indicador Vermelho Congo (Congo Red) na presença de carboximetilcelulose (CMC). Este ensaio identificará os clones produtores de celulases, e posteriormente as enzimas serão purificadas, e caracterizadas através da atividade catalítica e a determinação de seus parâmetros cinéticos, tais como temperatura e pH ótimos, velocidade máxima e constante Michaelis-Menten. A estratégia de enriquecimento das espécies produtoras de celulases na coluna de Winosgradsky combinada com a análise das sequências codificadoras de proteínas otimizará o processo de rastreamento das celulases nas amostras ambientais. Embora o foco do projeto sejam as celulases, as bibliotecas metagenômicas podem ser utilizadas na busca de outras enzimas com interesse na biorefinaria de biomassas como as lacases, pectinases, xilanases entre outras. | |
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