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Genotipagem de linhagens de Yersinia ssp. por high-resolution melting analysis

Processo: 09/08455-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2009
Data de Término da vigência: 31 de maio de 2013
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Pesquisador responsável:Juliana Pfrimer Falcão
Beneficiário:Roberto Antonio de Souza
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Yersinia   Técnicas de genotipagem
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Epidemiologia | gênero Yersinia | High-resolution Melting Analysis (HRMA) | Single nucleotide polymorphism (SNP) | Epidemiologia, filogenia e taxonomia de microrganismos

Resumo

O gênero Yersinia compreende 15 espécies. Y. enterocolitica, Y. pseudotuberculosis e Y. pestis são patógenos de vários animais, incluindo o homem. Y. aldovae, Y. bercovieri, Y. frederiksenii, Y. intermedia, Y. kristensenii, Y. aleksiciae, Y. mollaretii e Y. rohdei são encontradas, sobretudo, no meio ambiente e alimentos e consideradas, usualmente, como bactérias oportunistas não-patogênicas. Y. ruckeri é um importante patógeno de peixes. Recentemente, três novas espécies, denominadas Y. similis, Y. massiliensis e Y. entomophaga, foram propostas. As diversas espécies pertencentes a esse gênero encontram-se amplamente distribuídas ao redor do mundo, causando doenças de sintomatologias e gravidade variáveis. Desta maneira, é de grande importância ter novas e vantajosas ferramentas moleculares com finalidades epidemiológicas e de grande acessibilidade. Devido ao grande uso de single-nucleotide polimorphisms (SNP) como marcadores para variação genética, vários métodos de genotipagem baseados em SNP foram desenvolvidos nas últimas décadas. High-resolution melting analysis (HRMA) é uma tecnologia atrativa, avançada, rápida e barata para a genotipagem de SNP baseada na análise do perfil de melting de um produto de PCR e que possui muitas vantagens sobre outros métodos de genotipagem. Esse projeto tem como principal objetivo padronizar a técnica de genotipagem de SNPs por HRMA para o gênero Yersinia e aplicar essa metodologia na genotipagem de linhagens de Y. pseudotuberculosis isoladas no Brasil. Os resultados permitirão aumentar o acesso a novas metodologias de tipagem molecular que contribuam para a caracterização filogenética e epidemiológica do gênero Yersinia. (AU)

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Publicações científicas (7)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUZA, ROBERTO A.; FALCAO, JULIANA P.. A novel high-resolution melting analysis-based method for Yersinia enterocolitica genotyping. Journal of Microbiological Methods, v. 106, p. 129-134, . (10/19830-5, 09/08455-1)
SOUZA, ROBERTO A.; IMORI, PRISCILLA F. M.; FALCAO, JULIANA P.. Multilocus sequence analysis and 16S rRNA gene sequencing reveal that Yersinia frederiksenii genospecies 2 is Yersinia massiliensis. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 63, n. 8, p. 3124-3129, . (06/51434-7, 09/08455-1, 09/10084-1)
IMORI, PRISCILLA F. M.; PASSAGLIA, JAQUELINE; SOUZA, ROBERTO A.; ROCHA, LENALDO B.; FALCAO, JULIANA P.. Virulence-related genes, adhesion and invasion of some Yersinia enterocolitica-like strains suggests its pathogenic potential. Microbial Pathogenesis, v. 104, p. 72-77, . (10/19830-5, 09/08455-1, 12/19132-1)
SOUZA, ROBERTO A.; FRAZAO, MILIANE R.; ALMEIDA, ALZIRA M. P.; FALCAO, JULIANA P.. Rapid and efficient differentiation of Yersinia species using high-resolution melting analysis. Journal of Microbiological Methods, v. 115, p. 6-12, . (10/19830-5, 09/08455-1)
SOUZA, R. A.; IMORI, P. F. M.; PASSAGLIA, J.; PITONDO-SILVA, A.; FALCAO, J. P.. Molecular typing of Yersinia pseudotuberculosis strains isolated from livestock in Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 4, p. 4869-4878, . (09/08455-1, 06/51434-7, 07/07784-6)
SOUZA, ROBERTO A.; FALCAO, JULIANA P.. A novel high-resolution melting analysis-based method for Yersinia pseudotuberculosis genotyping. Journal of Microbiological Methods, v. 91, n. 3, p. 329-335, . (10/19830-5, 09/08455-1)
SOUZA, ROBERTO A.; IMORI, PRISCILLA F. M.; FALCAO, JULIANA P.. Multilocus sequence analysis and 16S rRNA gene sequencing reveal that Yersinia frederiksenii genospecies 2 is Yersinia massiliensis. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, v. 63, p. 6-pg., . (09/10084-1, 09/08455-1, 06/51434-7)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
SOUZA, Roberto Antonio de. Genotipagem de linhagens de Yersinia spp. por high-resolution melting analysis. 2013. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (PCARP/BC) Ribeirão Preto.

Patente(s) depositada(s) como resultado deste projeto de pesquisa

MÉTODO DE IDENTIFICAÇÃO DE ESPÉCIES BACTERIANAS E KIT PARA O DIAGNÓSTICO DE BACTÉRIAS BR1020140081623 - Universidade de São Paulo (USP) . Ebert Seixas Hanna ; Juliana Pfrimer Falcao ; Roberto Antonio de Souza - 04 de abril de 2014