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Estudo genômico da ingestão e eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore

Processo: 12/02039-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2012
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2014
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:José Bento Sterman Ferraz
Beneficiário:José Bento Sterman Ferraz
Instituição Sede: Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos (FZEA). Universidade de São Paulo (USP). Pirassununga , SP, Brasil
Assunto(s):Bovinocultura de corte  Gado Nelore  Eficiência alimentar  Consumo alimentar residual  Nutrigenômica  Polimorfismo de um único nucleotídeo  Genótipo  Marcadores genéticos 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:análise de associação genômica | Bovinos de corte | Consumo alimentar residual | eficiência de produção | Nutrigenética | Marcadores genéticos, Melhoramento Genético de Bovinos de Corte

Resumo

Este é um projeto essencialmente multidisciplinar e que requer cooperação entre várias instituições. Os avanços nas últimas décadas da genética e biologia molecular possibilitaram o sequenciamento completo do genoma bovino, bem como abriu um largo leque de novas possibilidades de estudo nesse genoma. A ferramenta mais utilizada na avaliação de dados genômicos associados à produção de bovinos é a identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP). Muitos SNP já foram identificados em Bos taurus, em diversos genes relacionados com desempenho ponderal, qualidade de carcaça, eficiência alimentar e outras características produtivas. Em zebuínos ainda são raros os estudos com milhares de SNP associados com características de interesse zootécnico, principalmente os que consideram as importantes características ligadas à eficiência e ingestão alimentar. O objetivo desse projeto é caracterizar e associar alguns SNP com ingestão e eficiência alimentar além de estimar o valor genético molecular para essas características em bovinos da raça Nelore, a mais expressiva e importante na pecuária brasileira. Serão utilizados dados de ingestão de matéria seca e eficiência alimentar de cerca de 370 bovinos dessa raça. A partir dessa amostra, o DNA genômico individual será extraído e posteriormente essas amostras de DNA serão genotipadas por meio de chips comerciais (BovineHD e BovineSNP50 Beadchip®, Illumina Inc). Esses dados genômicos serão utilizados, em conjunto com os dados fenotípicos, para caracterização dos SNP e cálculo de frequências gênicas e genotípicas, efeitos aditivos, de substituição alélica e dominância. Adicionalmente, serão incluídos dados de pedigree para estimar o valor genético molecular de cada animal por meio de metodologia GBLUP e métodos Bayesianos (Bayes A, B, C, CÀ e Lasso). (AU)

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Publicações científicas (13)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SANTANA, MIGUEL H. A.; UTSUNOMIYA, YURI T.; NEVES, HAROLDO H. R.; GOMES, RODRIGO C.; GARCIA, JOSE F.; FUKUMASU, HEIDGE; SILVA, SAULO L.; OLIVEIRA JUNIOR, GERSON A.; ALEXANDRE, PAMELA A.; LEME, PAULO R.; et al. Genome-wide association analysis of feed intake and residual feed intake in Nellore cattle. BMC GENETICS, v. 15, . (12/03551-5, 11/16643-2, 12/02039-9)
FREUA, MATEUS CASTELANI; DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE; VENTURA, RICARDO VIEIRA; TEDESCHI, LUIS ORLINDO; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO. Using a system of differential equations that models cattle growth to uncover the genetic basis of complex traits. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 58, n. 3, p. 393-400, . (13/26902-0, 13/20571-2, 14/07566-2, 12/02039-9)
GRIGOLETTO, L.; PEREZ, B. C.; SANTANA, M. H. A.; BALDI, F.; FERRAZ, J. B. S.. Genetic contribution of cytoplasmic lineage effect on feed efficiency in Nellore cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 198, p. 52-57, . (13/20571-2, 14/07566-2, 12/02039-9)
SANTANA, M. H. A.; GOMES, R. C.; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. R.; NOVAIS, F. J.; BONIN, M. N.; FUKUMASU, H.; GARCIA, J. F.; ALEXANDRE, P. A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; et al. Genome-wide association with residual body weight gain in Bos indicus cattle. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 2, p. 5229-5233, . (13/20571-2, 12/02039-9)
SANTANA, M. H. A.; FREUA, M. C.; DO, D. N.; VENTURA, R. V.; KADARMIDEEN, H. N.; FERRAZ, J. B. S.. Systems genetics and genome-wide association approaches for analysis of feed intake, feed efficiency, and performance in beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 4, . (13/20571-2, 12/02039-9, 14/14121-7, 13/26902-0, 14/07566-2)
FREUA, MATEUS CASTELANI; DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO. A new approach for applied nutritional models: Computing parameters of dynamic mechanistic growth models using genorne-wide prediction. LIVESTOCK SCIENCE, v. 190, p. 131-135, . (13/26902-0, 13/20571-2, 14/07566-2, 12/02039-9)
SANTANA, M. H. A.; VENTURA, R. V.; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. R.; ALEXANDRE, P. A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; GOMES, R. C.; BONIN, M. N.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, J. F.; et al. A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 132, n. 6, p. 420-427, . (14/14121-7, 13/20571-2, 12/02039-9)
DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE; GEBIM POLIZEL, GUILHERME HENRIQUE; GRIGOLETTO, LAIS; FERNANDES, ARICIA CHRISTOFARO; BONIN, MARINA DE NADAI; GOMES, RODRIGO DA COSTA; CARVALHO, MINOS ESPERANDIO; DA LUZ E SILVA, SAULO; LEME, PAULO ROBERTO; ROSSI JUNIOR, PAULO; et al. The genetic and genomic effects of Nellore lineages on feed efficiency, intake and performance. LIVESTOCK SCIENCE, v. 228, p. 104-108, . (13/20571-2, 13/26902-0, 14/07566-2, 12/02039-9)
GEBIM POLIZEL, GUILHERME HENRIQUE; GRIGOLETTO, LAIS; CARVALHO, MINOS ESPERANDIO; ROSSI JUNIOR, PAULO; STERMAN FERRAZ, JOSE BENTO; DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE. Genetic correlations and heritability estimates for dry matter intake, weight gain and feed efficiency of Nellore cattle in feedlot. LIVESTOCK SCIENCE, v. 214, p. 209-210, . (13/26902-0, 13/20571-2, 14/07566-2, 12/02039-9)
DE ALMEIDA SANTANA, MIGUEL HENRIQUE; OLIVEIRA JUNIOR, GERSON ANTONIO; MELLO CESAR, ALINE SILVA; FREUA, MATEUS CASTELANI; GOMES, RODRIGO DA COSTA; DA LUZ E SILVA, SAULO; LEME, PAULO ROBERTO; FUKUMASU, HEIDGE; CARVALHO, MINOS ESPERANDIO; VENTURA, RICARDO VIEIRA; et al. Copy number variations and genome-wide associations reveal putative genes and metabolic pathways involved with the feed conversion ratio in beef cattle. JOURNAL OF APPLIED GENETICS, v. 57, n. 4, p. 495-504, . (12/02039-9, 13/20571-2, 14/14121-7)
SANTANA, M. H. A.; OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; GOMES, R. C.; SILVA, S. L.; LEME, P. R.; STELLA, T. R.; MATTOS, E. C.; ROSSI JUNIOR, P.; BALDI, F. S.; ELER, J. P.; et al. Genetic parameter estimates for feed efficiency and dry matter intake and their association with growth and carcass traits in Nellore cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 167, p. 80-85, . (12/03551-5, 12/02039-9)
SANTANA, M. H. A.; GOMES, R. C.; OZAWA, G. M.; FUKUMASU, H.; SILVA, S. L.; LEME, P. R.; ROSSI JUNIOR, P.; PIRES, P. R. L.; ALEXANDRE, P. A.; OLIVEIRA, P. S.; et al. Single nucleotide polymorphisms in genes linked to ion transport and regulation of appetite and their associations with weight gain, feed efficiency and intake of Nellore cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 165, p. 33-36, . (12/03551-5, 12/02039-9)
SANTANA, M. H. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. R.; GOMES, R. C.; GARCIA, J. F.; FUKUMASU, H.; SILVA, S. L.; LEME, P. R.; COUTINHO, L. L.; ELER, J. P.; et al. Genome-wide association study for feedlot average daily gain in Nellore cattle (Bos indicus). JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 131, n. 3, p. 210-216, . (12/03551-5, 11/16643-2, 12/02039-9)