Construindo uma Plataforma de Biologia Sintética para a Triagem Funcional de Sequencias Promotoras em Plantas

Resumo

A biologia sintética usa a engenharia de vários genes para a construção de circuitos de DNA que podem ser programados para controlar o comportamento celular. A criação de partes genéticas padrão a serem usadas como blocos de construção e montadas de maneira confiável é uma necessidade. Assim como, a compreensão da estrutura mínima e combinação de genes ou informações que são necessárias para a criação de uma função específica. Esta nova área precisa de ferramentas que permitam a criação, caracterização e incorporação destas novas partes genéticas em uma alta escala, assim como, o seu depósito nas bases dados.O problema que este projeto pretende abordar é a necessidade de ferramentas para caracterizar partes genéticas de uma forma experimental rápida, como são as regiões promotoras de plantas (partes genéticas) e seus padrões de expressão específicos de tecidos (contexto de interação).Como prova de conceito o projeto irá gerar uma biblioteca de sequências promotoras de tabaco usando uma estratégia de clonagem aleatória de regiões genômicas, previamente estabelecida para cana-de-açúcar no GaTELab da Universidade de São Paulo. A biblioteca terá um componente virtual e outro físico.Alem de ampliar o uso da clonagem aleatória de promotores em tabaco, o principalobjetivo deste projeto é desenvolver a plataforma de triagem in planta que usa a expressãoconstitutiva da proteína fluorescente vermelha como indicador de atividade tecido-especificodos promotores em tabaco. A biblioteca de tabaco e uma biblioteca de cana-de-açúcar, criadapreviamente com esta mesma estratégia, serão usadas para testar a plataforma