Perfil de expressão dos Retrovírus Endógenos Humanos da família W (HERV-W) em indivíduos com Esclerose Múltipla em condições de recorrência

Resumo

Os HERVs são retrovírus endógenos, que se fixaram no genoma do hospedeiro através de integrações nos genomas de células germinativas a milhões de anos atrás, representando hoje aproximadamente 8% do genoma humano. A presença e atividade esporádica destes no nosso genoma serviram de incentivo para diversos estudos que tentam correlacionar o seu envolvimento com doenças autoimunes incluindo a Esclerose Múltipla (EM). A EM é uma doença sem etiologia definida, de difícil tratamento e extremamente complexa. Possui um estágio inflamatório e é caracterizada principalmente pelo caráter progressivo e degenerativo. Diversos achados importantes levantaram o interesse sobre a possível relação do HERV da família W com a EM. Esses retrovírus podem apresentar desde altos níveis de RNA mensageiro circulante até a presença da proteína do gene env do HERV-W em lesões desmielinizantes de indivíduos com EM. Alem disso, não se tem conhecimento de quais elementos exatamente são expressos, e em que proporções. Considerando ainda o caráter altamente imonogênico de epítopos de certos genes retrovirus, não se sabe se a atividade dos retroelementos é capaz de interferir na expressão de genes relacionados a processos inflamatórios e/ou imunológicos. Uma ferramenta disponível atualmente que poderá auxiliar nesse entendimento é o Next Generation Sequencing (NGS). O transcriptoma realizado por essa metodologia fornecerá dados massivos referente a todo perfil de expressão do HERV-W, bem como dos genes responsáveis pela expressão das citocinas pró-inflamatórias e anti-inflamatórias dos indivíduos com EM. O principal objetivo desse estudo, portanto, será comparar o transcriptoma de HERV-W de indivíduos com EM em momento de recorrência com o perfil de expressão de indivíduos saudáveis.Serão coletadas 20 amostras de sangue sendo 10 de indivíduos com EM em condições de recorrência (GMS) e 10 indivíduos saudáveis (GC) as quais serão submetidas ao trascriptoma (RNAseq) pela plataforma Ion Proton. Para análise dos transcritos serão utilizadas como referência sequências de HERV e sequências de genes responsáveis pela expressão de citocinas pró e anti-inflamatórias. As análises das sequências obtidas pelo RNAseq serão realizadas com o auxilio do programas Geneious e CLC Genomics Workbench 5. Além disso, os níveis plasmáticos dessas citocinas também serão mensurados para que se possa estabelecer uma relação entre atividade/repressão dos genes associados e níveis plasmáticos.