Análise global das mudanças no transcriptoma da cana-de-açúcar em resposta à seca

Resumo

A cana-de-açúcar é uma cultura economicamente importante no Brasil, e para atingir a atual demanda em açúcar e etanol o Brasil deve expandir a área plantada. No entanto, áreas de plantio adequadas são cada vez mais escassas, o que leva à necessidade de utilizar ambientes adversos, submetendo, dessa forma, as plantas às severas condições abióticas. Consequentemente, é essencial desenvolver plantas que apresentem maior tolerância a estresses, em especial a seca. O projeto SUCEST, combinado com o sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar, começou a sedimentar o caminho para os futuros estudos biotecnológicos. Agora é necessário elucidar a relação existente entre expressão e regulação gênica e características agronômicas de interesse com o objetivo de melhorar a tolerância à seca por meio de técnicas moleculares. A técnica de ChIP-Seq tem sido aplicada no estudo de interações in vivo entre DNA e proteínas e fornece uma ferramenta poderosa para elucidar a arquitetura de redes transcricionais. Apesar disso, poucos dados relacionados à sua aplicação em cana-de-açúcar estão publicamente disponíveis. A ausência do genoma completamente sequenciado da cana torna a sua aplicação ainda mais desafiadora. No entanto, em colaboração com vários grupos, o primeiro rascunho do genoma da cana está sendo obtido e será usado para as análises de ChIP-Seq. O estudo dos locais do genoma que são alvos da RNA Polimerase II (RNPII) é importante uma vez que permite a identificação de promotores ativos expressos sob diferentes condições e constitui uma abordagem interessante para estudar a regulação transcricional de genes relacionados à seca. O objetivo desse projeto é definir um conjunto de sequencias genômicas ligadas à RNPII, entender seu mecanismo de ligação e identificar promotores e genes que são ativados sob as condições de seca. A longo prazo, este projeto objetiva gerar ferramentas que irão permitir à comunidade científica associar motivos regulatórios com características como a seca. (AU)