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Diagnóstico do esôfago de Barrett auxiliado por computador utilizando técnicas de aprendizado de máquina

Processo: 19/08605-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
Data de Início da vigência: 23 de setembro de 2019
Data de Término da vigência: 22 de setembro de 2020
Área de conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Metodologia e Técnicas da Computação
Pesquisador responsável:João Paulo Papa
Beneficiário:Luis Antonio de Souza Júnior
Supervisor: Christoph Palm
Instituição Sede: Centro de Ciências Exatas e de Tecnologia (CCET). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Ostbayerische Technische Hochschule Regensburg (OTH Regensburg), Alemanha  
Vinculado à bolsa:17/04847-9 - Auxílio ao Diagnóstico Automático do Esôfago de Barrett Utilizando Aprendizado de Máquina, BP.DR
Assunto(s):Esôfago de Barrett   Aprendizado computacional   Inteligência artificial   Reconhecimento de padrões
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Aprendizado de Máquina | Aprendizado em Profundidade | Esôfago de Barrett | Imagens endoscópicas | Inteligência Artificial | Reconhecimento de Padrões | Processamento e Análise de Imagens Médicas

Resumo

O câncer no esôfago é uma doença de difícil detecção nos estágios iniciais, especialmente na presença do esôfago de Barrett. O desenvolvimento de sistemas automáticos de avaliação de tal doença podem ser muito úteis, auxiliando os especialistas na detecção da região cancerígena. Com o forte crescimento das técnicas de aprendizado de máquina e, visando melhorar a eficácia do diagnóstico médico, seu uso caracteriza um cenário forte a ser explorado para o diagnóstico precoce do adenocarcinoma de esôfago. O esôfago de Barrett como antecessor do adenocarcinoma pode ser explicado por alguns fatores de risco, como obesidade, tabagismo e diagnóstico médico tardío. Este projeto, portanto, propõe o desenvolvimento de novas técnicas de visão computacional e aprendizado de máquina para auxiliar o diagnóstico automático do adenocarcinoma esofágico. Esta proposta de pesquisa no exterior relaciona o tempo em que o professor Christoph Palm, co-orientador de tal projeto em desenvolvimento no Brasil, ajudará e supervisionará o seu desenvolvimento. O Professor Palm oferece uma contribuição substancial e muito importante para o trabalho proposto, considerando sua relevante e consistente pesquisa relacionada à avaliação assistida por computador de imagens médicas. Além disso, o grupo de pesquisa no exterior, liderado pelo Professor Palm (ReMIC), também oferece conhecimento relevante a ser compartilhado, uma vez que possui foco na área de processamento de imagens médicas. Serão adquiridas, durante o período no exterior, novas bases de dados endoscópicas para avaliação das características extraídas a mão já estudadas, presenciadas pelo aluno da atual proposta e colocando-o em contato direto com os responsáveis pela anotação manual das imagens endoscópicas. Ainda, o aluno iniciará a avaliação do adenocarcinoma e da diferenciação do esôfago de Barrett usando técnicas de aprendizado em profundidade, auxiliado pelo Professor Palm e pelos membros da equipe do ReMIC. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DE SOUZA JR, LUIS A.; PASSOS, LEANDRO A.; MENDEL, ROBERT; EBIGBO, ALANNA; PROBST, ANDREAS; MESSMANN, HELMUT; PALM, CHRISTOPH; PAPA, JOAO P.. Assisting Barrett's esophagus identification using endoscopic data augmentation based on Generative Adversarial Networks. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, v. 126, . (13/07375-0, 19/07665-4, 19/08605-5, 17/04847-9, 14/12236-1)
DE SOUZA JR, LUIS A.; MENDEL, ROBERT; STRASSER, SOPHIA; EBIGBO, ALANNA; PROBST, ANDREAS; MESSMANN, HELMUT; PAPA, JOAO P.; PALM, CHRISTOPH. Convolutional Neural Networks for the evaluation of cancer in Barrett's esophagus: Explainable AI to lighten up the black-box. COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, v. 135, . (17/04847-9, 16/19403-6, 14/12236-1, 13/07375-0, 19/08605-5)