| Processo: | 22/01483-4 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 30 de junho de 2022 |
| Data de Término da vigência: | 29 de junho de 2023 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Bioquímica - Enzimologia |
| Pesquisador responsável: | Marcelo Bispo de Jesus |
| Beneficiário: | Fernanda Garcia Fóssa |
| Supervisor: | Anne Carpenter Van Dyk |
| Instituição Sede: | Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Broad Institute, Estados Unidos |
| Vinculado à bolsa: | 19/24033-1 - Alterações sutis desencadeadas por nanopartículas em células analisadas individualmente através de perfil multiparamétrico baseada em imagem, BP.DR |
| Assunto(s): | Processamento de imagens Aprendizado computacional Nanotoxicologia Materiais nanoestruturados |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | hepatocyte | Image processing | Image-based Profiling | machine learning | Nanotoxicology | Phenotypic profiling | Nanotoxicologia |
Resumo Os nanomateriais estão presentes na vida cotidiana, nas residências e em produtos médicos. A distribuição generalizada de nanomateriais no meio ambiente levou ao seu acúmulo na água e biossólidos. Consequentemente, humanos são expostos a baixas concentrações de nanomateriais, resultando em intoxicação por exposição ao longo da vida. No entanto, o estudo da nanotoxicidade tem se concentrado em morte celular causada por altas concentrações de nanomateriais. Portanto, nosso projeto visa estudar as mudanças sutis desencadeadas pela exposição a nanopartículas em condições ambientais mais relevantes (ou seja, baixas concentrações). Para detectar essas alterações, analisaremos o perfil fenotípico de células tratadas com nanopartículas usando análise multiparamétrica de célula individualizada baseada em imagem. A análise e o agrupamento desses parâmetros são feitos por meio de processamento de imagens, perfil fenotípico, machine learning e técnicas de deep learning. Para desenvolver esse pipeline analítico de ponta a ponta, solicitamos um estágio de doze meses no laboratório Carpenter-Singh supervisionado pela Dra. Anne Carpenter no Broad Institute do MIT e Harvard. Dr. Carpenter possui vasta experiência em processamento de imagem e perfil fenotípico baseado em imagem, como demonstrado pelo desenvolvimento do CellProfiler eCellProfiler Analyst, softwares utilizados por pesquisadores de todo o mundo. O objetivo do projeto a longo prazo é implementar uma plataforma para avaliar o efeito de nanopartículas em células através de perfil de célula individualizada baseado em imagem para permitir a continuidade desta pesquisa dentro do Instituto de Biologia da Universidade Estadual de Campinas. A plataforma identificará mudanças sutis causadas por uma variedade de nanopartículas e contribuir para a avaliação de risco e base teórica para desenvolver estratégias de manejo terapêutico. (AU) | |
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