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Alterações sutis desencadeadas por nanopartículas em células analisadas individualmente através de perfil multiparamétrico baseada em imagem

Processo: 19/24033-1
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2020
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2024
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Enzimologia
Pesquisador responsável:Marcelo Bispo de Jesus
Beneficiário:Fernanda Garcia Fóssa
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):22/01483-4 - Alterações sutis desencadeadas por nanopartículas em células analisadas individualmente através de perfil multiparamétrico baseada em imagem, BE.EP.DR
Assunto(s):Aprendizado computacional   Nanotoxicologia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:low-dose | machine learning | nanotoxicologia | Nanotoxicologia

Resumo

Os nanomateriais estão presentes na vida cotidiana, em produtos para uso doméstico e em aplicações médicas. A difusão de nanomateriais no ambiente vem causando um acúmulo em água e biossólidos em baixas concentrações, o que pode causar intoxicação humana por exposições ao longo da vida. No entanto, os estudos de toxicidade se concentram nos mecanismos de morte causados por altas concentrações. Nosso projeto tem como objetivo investigar alterações sutis desencadeadas por exposição à nanopartículas em baixas concentrações. Para detectar essas alterações utilizaremos os perfis fenotípicos multiparamétrico de células individuais obtidos através de imagens de microscopia de fluorescência. A análise e agrupamento desses parâmetros será feita através do uso de ferramentas da ciência de dados como aprendizagem de máquina. Essa abordagem visa desenvolver uma plataforma robusta para identificar alterações sutis causadas por nanopartículas, contribuindo com a base teórica para a avaliação de risco e para o desenvolvimento de estratégias de manejo terapêutico.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GARCIA-FOSSA, FERNANDA; CRUZ, MARIO COSTA; HAGHIGHI, MARZIEH; DE JESUS, MARCELO BISPO; SINGH, SHANTANU; CARPENTER, ANNE E.; CIMINI, BETH A.. Interpreting Image-based Profiles using Similarity Clustering and Single-Cell Visualization. CURRENT PROTOCOLS, v. 3, n. 3, p. 21-pg., . (19/24033-1, 22/01483-4, 20/01218-3)
GARCIA-FOSSA, FERNANDA; MORAES-LACERDA, THAIS; RODRIGUES-DA-SILVA, MARIANA; DIAZ-ROHRER, BARBARA; SINGH, SHANTANU; CARPENTER, ANNE E.; CIMINI, BETH A.; DE JESUS, MARCELO BISPO. Live-cell painting: Image-based profiling in live cells using acridine orange. MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL, v. 36, n. 7, p. 11-pg., . (19/24033-1, 23/06143-0, 22/01483-4, 20/01218-3)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
FÓSSA, Fernanda Garcia. Alterações sutis desencadeadas por nanopartículas em células analisadas individualmente através de perfil multiparamétrico baseada em imagem. 2024. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.