Análise funcional in silico e construção de plasmídeo para nocaute CRISPR/Cas9-mediado do gene responsivo a estresse térmico Telomere Repeat-Binding Factor 1 em arroz (Oryza sativa L.)

Resumo

As mudanças climáticas são uma das principais fontes de preocupação acerca da segurança alimentar futura. Junto de maiores temperaturas médias de superfície, ondas de calor cada vez mais frequentes e intensas são previstas, com efeitos negativos na produção agrícola que podem afetar desproporcionalmente economias subdesenvolvidas e emergentes. O arroz, responsável mundialmente por 8% dos cultivos primários em 2019, é particularmente suscetível ao estresse térmico (ET) - uma vez que cultivares sob ET apresentam perdas tanto quantitativas (rendimento) quanto qualitativas. Logo, uma melhor compreensão dos componentes moleculares da resposta ao ET em arroz é fundamental para o desenvolvimento de cultivares tolerantes aos novos desafios ambientais. Dado que respostas ao estresse são dependentes de redes multi-ômicas, uma perspectiva centrada na biologia de sistemas deve ser empregada, caracterizando elementos responsivos genômicos, transcriptômicos e proteômicos dessas redes. Notavelmente, trabalhos recentes têm salientado diversos genes responsivos a ET em arroz, com expressão (E) e/ou splicing alternativo (SA) diferenciais (ED, SAD). Vale ressaltar que o SA, além de incrementar a diversidade proteômica, é implicado no rápido remodelamento do transcriptoma mediante mudanças nas condições ambientais. O respectivo trabalho visa, assim, caracterizar um gene codificante para o fator telômero-associado 1 (OsTRBF1) em arroz, ED/SAD no trabalho de Vitoriano & Calixto (2021). Será feita coleta e análise bioinformática de dados filogenéticos, de expressão tecido e condição-específica e de motivos indicativos de regulação a nível do promotor gênico de OsTRBF1. Pretende-se também gerar um plasmídeo que permita futuro nocaute do gene referido em experimentos in vivo. (AU)