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Análise dos mecanismos de regulação transcricional mediados pelo lincRNA PVT1 em modelo de cancer de prostata

Processo: 22/11192-7
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2024
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Sergio Verjovski Almeida
Beneficiário:Fábio Nunes de Mello
Instituição Sede:Instituto Butantan. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/23693-5 - Mecanismos de ação de RNAs longos não-codificadores envolvidos nos programas de ativação gênica em eucariotos, AP.TEM
Assunto(s):Biologia computacional   Epigênese genética   Neoplasias da próstata   Regulação da expressão gênica   RNA longo não codificante
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:bioinformática | Epigênese Genética | Neoplasias da Próstata | Regulação da expressão gênica | RNA longo não codificante | Biologia Computacional

Resumo

O desenvolvimento de câncer de próstata é conhecidamente dependente da presença do hormônio andrógeno, com o receptor de andrógeno (AR) atuando para regular a transcrição de centenas de genes envolvidos com o processo oncogênico. Porém, pouco ainda se sabe sobre os exatos mecanismos para essa regulação. Já foi demonstrado que diversos RNAs não-codificantes intergênicos longos (lincRNAs) podem se associar a AR, recrutando enzimas modificadoras da cromatina e direcionando sua atuação no genoma, porém poucos desses lincRNAs foram caracterizados por completo, ainda menos em escala genômica. Dando sequência a trabalhos prévios do nosso laboratório, nós focamos no lincRNA PVT1, oncogene cuja super-expressão é observada em diversos tipos de câncer mas cujo mecanismo de tumorigênese ainda não é caracterizado. Para isso, desenvolvemos um modelo de knockdown de PVT1 em linhagem de células de câncer de próstata, e pretendemos avaliar o impacto da diminuição de PVT1 sobre a deposição de diferentes marcas de cromatina e proteínas regulatórias ao longo do genoma. Ademais, pretendemos analisar os efeitos do knockdown e da presença do hormônio andrógeno no transcriptoma dessas células, a fim de correlacionar as marcas epigenéticas observadas e as mudanças de expressão gênica induzidas pela associação de PVT1 e AR, para caracterizar seus mecanismos oncogênicos em câncer de próstata.

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Publicações científicas
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
DE MELLO, FABIO N.; TAHIRA, ANA C.; BERZOTI-COELHO, MARIA GABRIELA; VERJOVSKI-ALMEIDA, SERGIO. The CUT&RUN greenlist: genomic regions of consistent noise are effective normalizing factors for quantitative epigenome mapping. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, v. 25, n. 2, p. 15-pg., . (18/23693-5, 22/11192-7, 20/02976-9)