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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Water-driven stabilization of diphenylalanine nanotube structures

Texto completo
Autor(es):
Andrade-Filho, T. [1] ; Martins, Tiago Carvalho [1] ; Ferreira, Fabio Furlan [2] ; Alves, Wendel Andrade [2] ; Rocha, Alexandre Reily [3]
Número total de Autores: 5
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Fed Sul & Sudeste Para UNIFESSPA, Fac Fis, BR-68505080 Maraba, Para - Brazil
[2] Univ Fed ABC, Ctr Ciencias Nat & Humanas, BR-09210180 Sao Paulo - Brazil
[3] Univ Estadual Paulista UNESP, Inst Fis Teor, BR-01140070 Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 3
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: THEORETICAL CHEMISTRY ACCOUNTS; v. 135, n. 8 JUL 11 2016.
Citações Web of Science: 13
Resumo

L,L-diphenylalanine has been employed in the formation of self-assembled peptide nanotubes with great potential for the development of biosensors, molecular carriers, and optoelectronic devices. They are usually formed in an aqueous solution, and it is well known that water remains confined inside the structure. However, the role played by water in the overall stability of the nanotube is still unknown at the microscopic level. In this work, we investigate the stability of peptide structures after assembly due to the interaction with water molecules. We demonstrate, using molecular dynamics based on density functional tight-binding techniques, that water is fundamental in keeping the nanotube structure. It interacts with the nanotube walls as well as with other water molecules via hydrogen bonds keeping the structure stable. We identify and quantify the interaction between water and the relevant groups, and, upon increasing the solvent concentration, we show there is a transition region where there is a competition between the formation of water/water hydrogen bonds, and steric effects. (AU)

Processo FAPESP: 13/12997-0 - Auto-organização hierárquica de peptídeos anfifílicos: mecanismos fundamentais e potenciais aplicações
Beneficiário:Wendel Andrade Alves
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 08/57805-2 - Instituto de Bioanalítica
Beneficiário:Lauro Tatsuo Kubota
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 13/02112-0 - Simulações de transporte eletrônico em grafeno utilizando métodos híbridos QM/MM: aplicações no sequenciamento de DNA e detecção de proteínas
Beneficiário:Alexandre Reily Rocha
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 11/11973-4 - ICTP Instituto Sul-Americano para Pesquisa Fundamental: um centro regional para física teórica
Beneficiário:Nathan Jacob Berkovits
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático