| Texto completo | |
| Autor(es): |
Cauz-Santos, Luiz Augusto
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da Costa, Zirlane Portugal
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Callot, Caroline
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Cauet, Stephane
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Zucchi, Maria Imaculada
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Berges, Helene
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van den Berg, Cassio
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Carneiro Vieira, Maria Lucia
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Número total de Autores: 8
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| Afiliação do(s) autor(es): | [1] Univ Sao Paulo, Dept Genet, Escola Super Agr Luiz de Queiroz, Piracicaba, SP - Brazil
[2] INRA, Ctr Natl Ressources Genom Vegetales, Castanet Tolosan - France
[3] Agencia Paulista Tecnol Agronegocios, Polo Reg Desenvolvimento Tecnol Ctr Sul, Piracicaba, SP - Brazil
[4] Univ Estadual Feira de Santana, Dept Ciencias Biol, Feira De Santana, BA - Brazil
Número total de Afiliações: 4
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION; v. 12, n. 10, p. 1841-1857, OCT 2020. |
| Citações Web of Science: | 0 |
| Resumo | |
Chloroplast genomes (cpDNA) in angiosperms are usually highly conserved. Although rearrangements have been observed in some lineages, such as Passiflora, the mechanisms that lead to rearrangements are still poorly elucidated. In the present study, we obtained 20 new chloroplast genomes (18 species from the genus Passiflora, and Dikea retusa and Mitostemma brevifilis from the family Passifloraceae) in order to investigate cpDNA evolutionary history in this group. Passiflora cpDNAs vary in size considerably, with -50 kb between shortest and longest. Large inverted repeat (IR) expansions were identified, and at the extreme opposite, the loss of an IR was detected for the first time in Passiflora, a rare event in angiosperms. The loss of an IR region was detected in Passiflora capsularis and Passiflora cosiaricensis, a species in which occasional biparental chloroplast inheritance has previously been reported. A repertory of rearrangements such as inversions and gene losses were detected, making Passiflora one of the few groups with complex chloroplast genome evolution. We also performed a phylogenomic study based on all the available cp genomes and our analysis implies that there is a need to reconsider the taxonomic classifications of some species in the group. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 17/11815-6 - Inferências filogenéticas em Passiflora com base na análise de genomas cloroplastidiais |
| Beneficiário: | Maria Lúcia Carneiro Vieira |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Regular |
| Processo FAPESP: | 19/09210-4 - Genomas cloroplastidiais no gênero Passiflora: sequenciamento de cp-DNA, anotação e estudos comparativos |
| Beneficiário: | Luiz Augusto Cauz dos Santos |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto |
| Processo FAPESP: | 17/04216-9 - Genomas cloroplastidiais de passifloras: estrutura, inferências evolutivas e transferência de genes para o núcleo |
| Beneficiário: | Luiz Augusto Cauz dos Santos |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |
| Processo FAPESP: | 19/07838-6 - Descobrindo o genoma de Passiflora organensis: uma referência em Passifloraceae e para estudos evolutivos |
| Beneficiário: | Zirlane Portugal da Costa |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado |