TOPISO3D Viewer: Enhancing Topological Analysis through 3D Isosurfaces

Autor(es)

Silva, Jeronimo F. ; Fabris, Guilherme S. L. ; Sambrano, Julio R. ; Albuquerque, Anderson R. ; Maia, Ary S.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING; v. 63, n. 7, p. 15-pg., 2023-03-23.

Resumo

We present TOPISO3D Viewer, a software with a user-friendly graphical interface, that generates three-dimensional maps to analyze descriptors based on the Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM), applied in periodic and nonperiodic systems. The software also automates the launching of topological analysis calculations through the TOPOND package and generates a report that facilitates the identification of the values of the calculated descriptors, in the Bond Critical Points (BCP) and Critical Points of the Laplacian of the electron density (LCP), facilitating the classification of chemical interactions. The map projects created can be stored in the form of HTML files, for later consultation through any type of browser. For validation of the software, several systems with 0-3D dimensions were studied. In addition, the topology of urea molecular crystal and its isolated molecule were revisited. (AU)

• Processo FAPESP: 19/08928-9 - Modelagem e Simulações da Funcionalização de Nanotubos Porosos Inorgânicos
• Beneficiário: Julio Ricardo Sambrano
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 20/10380-9 - Estudo teórico da aplicabilidade de monocamadas de SiC poroso como material anodo em baterias de lítio-sódio
• Beneficiário: Nicolas Ferreira Martins
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Processo FAPESP: 22/03959-6 - Estruturas bidimensionais para armazenamento de energia e sensores de gases: a teoria direcionada a experimentalistas e para a divulgação científica
• Beneficiário: Julio Ricardo Sambrano
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 13/07296-2 - CDMF - Centro de Desenvolvimento de Materiais Funcionais
• Beneficiário: Elson Longo da Silva
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 22/00349-2 - Performance da adsorção de CO no grafenileno inorgânico à base de SiC dopado com Fe, Co e Mn
• Beneficiário: Nicolas Ferreira Martins
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado