Complete Genome Sequence of a Vaccinal Newcastle Disease Virus Strain Isolated from an Owl (Rhinoptynx clamator)

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Van Borm, Steven ; Rizotto, Lais S. ; Ullmann, Leila S. ; Scagion, Guilherme P. ; Malossi, Camila D. ; Simao, Raphael M. ; Araujo, Joao P., Jr. ; Cordeiro, Izabelle M. ; Keid, Lara B. ; Sousa Oliveira, Tricia Maria F. ; Soares, Rodrigo M. ; Martini, Matheus C. ; Orsi, Maria A. ; Arns, Clarice W. ; Ferreira, Helena L.

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: GENOME ANNOUNCEMENTS; v. 4, n. 6, p. 2-pg., 2016-11-01.

Resumo

A Newcastle disease virus (NDV) was isolated in chicken embryonated eggs after detection by real-time reverse transcription-PCR (RRT-PCR) from a captive owl swab. The complete genome sequence of APMV-1/Rhinoptynx clamator/Brazi1/22516/2009 (APMV-1, avian paramyxovirus type 1) was obtained using Illumina sequencing. Phylogenetic analysis of the complete genome classified the isolate within NDV class II genotype II. (AU)

• Processo FAPESP: 15/11510-5 - Desvendando as interações patógeno-hospedeiro e patógeno-patógeno utilizando abordagens de metagenômica viral e sequenciamento de última geração
• Beneficiário: Helena Lage Ferreira
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 11/09019-0 - Soroepidemiologia, detecção molecular e caracterização dos Paramyxovirus aviários do tipo 1 (Classe I e Classe II) em aves silvestres
• Beneficiário: Helena Lage Ferreira
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular