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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Molecular modeling of enzyme attachment on AFM probes

Texto completo
Autor(es):
Oliveira, Guedmiller S. [1] ; Leite, Fabio L. [2] ; Amarante, Adriano M. [2] ; Franca, Eduardo F. [3] ; Cunha, Richard A. [3] ; Briggs, James M. [4] ; Freitas, Luiz C. G. [1]
Número total de Autores: 7
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Fed Sao Carlos, Dept Chem, BR-13565905 Sao Carlos, SP - Brazil
[2] Univ Fed Sao Carlos, Dept Phys Chem & Math, Nanoneurobiophys Res Grp, BR-18052780 Sorocaba, SP - Brazil
[3] Univ Fed Uberlandia, Inst Chem, BR-38400902 Uberlandia, MG - Brazil
[4] Univ Houston, Dept Biol & Biochem, Houston, TX 77204 - USA
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS & MODELLING; v. 45, p. 128-136, SEP 2013.
Citações Web of Science: 6
Resumo

The immobilization of enzymes on atomic force microscope tip (AFM tip) surface is a crucial step in the development of nanobiosensors to be used in detection process. In this work, an atomistic modeling of the attachment of the acetyl coenzyme A carboxylase (ACC enzyme) on a functionalized AFM tip surface is proposed. Using electrostatic considerations, suitable enzyme surface orientations with the active sites of the ACC enzyme available for interactions with bulk molecules were found. A 50 ns molecular dynamics trajectory in aqueous solution was obtained and surface contact area, hydrogen bonding and protein stability were analyzed. The enzyme surface model proposed here with minor adjustment can be applied to study antigen antibody interactions as well as enzyme immobilization on silica for chromatography applications. (C) 2013 Elsevier Inc. All rights reserved. (AU)

Processo FAPESP: 07/05089-9 - Desenvolvimento de nanobiossensores usando a espectroscopia de força atômica: aplicação na detecção de pesticidas
Beneficiário:Fabio de Lima Leite
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 10/00463-2 - Estudo de materiais biológicos usando a microscopia de força atômica
Beneficiário:Gabrielle de Almeida Ribeiro
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Processo FAPESP: 10/04599-6 - Estudo de "superfícies inteligentes" para desenvolvimento de nanobiossensores
Beneficiário:Aline Cristine Nanuh da Silva
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 08/57859-5 - Controle biorracional de insetos pragas
Beneficiário:Maria Fátima das Graças Fernandes da Silva
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático