Ligand efficiency metrics considered harmful

Autor(es)

Kenny, Peter W. ^[1] ; Leitao, Andrei ^[1] ; Montanari, Carlos A. ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Inst Quim Sao Carlos, Grp Quim Med IQSC USP NEQUIMED, BR-13566590 Sao Carlos, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Journal of Computer-Aided Molecular Design; v. 28, n. 7, p. 699-710, JUL 2014.
• Citações Web of Science: 28

Resumo

Ligand efficiency metrics are used in drug discovery to normalize biological activity or affinity with respect to physicochemical properties such as lipophilicity and molecular size. This Perspective provides an overview of ligand efficiency metrics and summarizes thermodynamics of protein-ligand binding. Different classes of ligand efficiency metric are critically examined and the study concludes with suggestions for alternative ways to account for physicochemical properties when prioritizing and optimizing leads. (AU)

• Processo FAPESP: 11/20572-3 - Planejamento molecular de agentes tripanossomicidas para o tratamento da Doença de Chagas
• Beneficiário: Carlos Alberto Montanari
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Pesquisador Visitante - Internacional
• Processo FAPESP: 11/01893-3 - Otimização de agentes tripanossomatídeos por integração de ensaios in silico, biocalorimétricos e celulares
• Beneficiário: Carlos Alberto Montanari
• Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular