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Análises integradas de genética quantitativa e genômica para seleção de genótipos superiores de pacu (Piaractus mesopotamicus)

Processo:16/21011-9
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de maio de 2017
Data de Término da vigência: 30 de abril de 2019
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
Pesquisador responsável:Diogo Teruo Hashimoto
Beneficiário:Diogo Teruo Hashimoto
Instituição Sede: Centro de Aquicultura (CAUNESP). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:Jaboticabal
Pesquisadores associados:Fabiana Pilarski ; Rafael Vilhena Reis Neto ; Roberto Carvalheiro
Assunto(s):Genética aplicada  Genética de peixes  Peixes  Piscicultura  Marcador molecular 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Genética aplicada | marcador molecular | Peixe | Piscicultura | Genética de peixes

Resumo

A espécie Piaractus mesopotamicus (pacu) tem ocorrência nas bacias hidrográficas do rio Paraná-Paraguai e corresponde a um dos pescados mais produzidos na aquicultura brasileira. Desta forma, representa um dos principais peixes destinados para programas de melhoramento genético, especialmente devido à sua aceitação de mercado (nacional e internacional). O objetivo deste projeto é avaliar o desempenho de famílias de pacu em relação às características de crescimento e resistência à Aeromonas hydrophila, bem como caracterizar QTLs (quantitative trait locus) por meio de mapeamento gênico com SNPs (single nucleotide polymorphisms). Serão formadas 45 famílias de pacu no programa de melhoramento, das quais serão avaliados os parâmetros de genética quantitativa de cinco medidas de crescimento (peso e quatro características morfométricas), além da taxa de sobrevivência ao desafio bacteriano com Aeromonas hydrophila. Em relação à caracterização de QTLs, 10 famílias de pacu serão selecionadas para avaliação de cada característica (crescimento e resistência). Em seguida, o sequenciamento/genotipagem dos SNPs será realizado por meio de ddRAD-seq (double digest restriction site associated DNA sequencing), com as enzimas de restrição SphI e MluCI. Além da introdução de novas tecnologias genéticas para a indústria da aquicultura, a perspectiva é que as informações dos SNPs permitam a construção de mapas genéticos de alta densidade que, aliados aos estudos de desempenho zootécnico, permitirão otimizar a seleção de genótipos superiores para o melhoramento genético e aumentar a produtividade deste importante grupo de peixe. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
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Publicações científicas (8)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
MASCALI, FLORENCIA CARLA; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; POSNER, VICTORIA MARIA; RUBIOLO, JUAN ANDRES; HASHIMOTO, DIOGO TERUO; VILLANOVA, GABRIELA VANINA. High-quality genome assembly and annotation of the pacu Piaractus mesopotamicus: an aquatic genetic resource of South American aquaculture. AQUACULTURE INTERNATIONAL, v. 32, n. 7, p. 23-pg., . (18/08416-5, 16/21011-9, 22/09226-0, 20/11049-4)
MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, V, MILENA; LIRA, LIESCHEN V. G.; AGUDELO, JOHN F. G.; PILARSKI, FABIANA; REIS NETO, V, RAFAEL; YANEZ, JOSE M.; HASHIMOTO, DIOGO T.. Genetic parameters for resistance to Aeromonas hydrophila in the Neotropical fish pacu (Piaractus mesopotamicus). Aquaculture, v. 513, . (16/18294-9, 16/21011-9)
GOMEZ AGUDELO, JOHN FREDY; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; DE SOUZA BORGES, CAROLINA HELOISA; ARIEDE, RAQUEL BELINI; GUERRA LIRA, LIESCHEN VALERIA; DE OLIVEIRA NETO, RUBENS RICARDO; FREITAS, MILENA VIEIRA; LENIS SUCERQUIA, GUSTAVO ADOLFO; VERA, MANUEL; MUNOZ BERROCAL, MILTHON HONORIO; et al. Genomic selection signatures in farmed Colossoma macropomum from tropical and subtropical regions in South America. EVOLUTIONARY APPLICATIONS, v. 15, n. 4, p. 15-pg., . (16/21011-9)
MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, V, MILENA; BORGES, CAROLINA H. S.; LIRA, LIESCHEN V. G.; MENDES, NATALIA J.; AGUDELO, JOHN F. G.; CACERES, PABLO; BERROCAL, MILTHON H. M.; SUCERQUIA, GUSTAVO A. L.; et al. Development of a multi-species SNP array for serrasalmid fish Colossoma macropomum and Piaractus mesopotamicus. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, . (16/21011-9, 17/26900-9, 20/11049-4, 16/18294-9, 18/08416-5, 17/19717-3, 19/10662-7, 19/08972-8)
FREITAS, MILENA, V; LEMOS, CELMA G.; ARIEDE, RAQUEL B.; AGUDELO, JOHN F. G.; NETO, RUBENS R. O.; BORGES, CAROLINA H. S.; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; PORTO-FORESTI, FABIO; IOPE, ROGERIO L.; BATISTA, FABRICIO M.; et al. High-throughput phenotyping by deep learning to include body shape in the breeding program of pacu (Piaractus mesopotamicus). Aquaculture, v. 562, p. 8-pg., . (16/21011-9)
FREITAS, V, MILENA; LIRA, LIESCHEN V. G.; ARIEDE, RAQUEL B.; AGUDELO, JOHN F. G.; DE OLIVEIRA NETO, RUBENS RICARDO; BORGES, CAROLINA H. S.; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; GARCIA NETO, BALTASAR F.; CARVALHEIRO, ROBERTO; HASHIMOTO, DIOGO T.. Genotype by environment interaction and genetic parameters for growth traits in the Neotropical fish pacu (Piaractus mesopotamicus). Aquaculture, v. 530, . (16/21011-9)
MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; BORGES, CAROLINA H. S.; FREITAS, MILENA V.; ARIEDE, RAQUEL B.; PILARSKI, FABIANA; UTSUNOMIA, RICARDO; CARVALHEIRO, ROBERTO; GUTIERREZ, ALEJANDRO P.; PENALOZA, CAROLINA; YANEZ, JOSE M.; et al. Development of a SNP linkage map and genome-wide association study for resistance to Aeromonas hydrophila in pacu (Piaractus mesopotamicus). BMC Genomics, v. 21, n. 1, . (18/08416-5, 16/21011-9, 17/26900-9, 16/18294-9)
MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; HATA, MILENE ELISSA; KURADOMI, RAFAEL YUTAKA; DE FREITAS, MILENA VIEIRA; ARIEDE, RAQUEL BELINI; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ; ROBLEDO, DIEGO; HOUSTON, ROSS; HASHIMOTO, DIOGO TERUO. Transcriptome Profiling of Pacu (Piaractus mesopotamicus) Challenged With PathogenicAeromonas hydrophila: Inference on Immune Gene Response. FRONTIERS IN GENETICS, v. 11, . (16/21011-9, 17/26900-9)