Estudo de associação genômica ampla para resistência a Aeromonas hydrophila em tambaqui (Colossoma macropomum)

Resumo

Aeromonas hydrophila é uma bactéria gram-negativa considerada um patógeno nocivo à saúde humana e para peixes de ambientes de água doce. No Brasil, a aeromoniose provoca altas taxas de mortalidade em várias espécies de peixes, incluindo o tambaqui (Colossoma macropomum). Este estudo tem como objetivo realizar um estudo de associação genômica ampla para resistência a A. hydrophila em tambaqui. Os objetivos específicos são: 1) desenvolver um denso mapa de ligação utilizando dados de ddRAD-seq (sequenciamento de DNA associado a sítios de restrição de dupla digestão) em tambaqui; 2) caracterizar regiões genômicas de QTL (locus de características quantitativas) associadas à resistência a A. hydrophila em tambaqui. O sequenciamento/genotipagem por ddRAD-seq será caracterizado em 18 famílias de tambaqui desafiadas com A. hydrophila, o que permitirá avaliar milhares de SNPs (single nucleotide polymorphisms). As características avaliadas para resistência a doença serão taxa de sobrevivência e tempo de morte. Inicialmente, um mapa de ligação de densidade média (~ 15K SNPs) será construído para o tambaqui, que servirá para análises posteriores da associação genômica. Em seguida, modelos estatísticos para associação SNP/características serão aplicados para realizar estudos de associação genômica ampla e detectar QTLs. Os SNPs que tiverem associação significativa serão anotados funcionalmente por comparações com genomas de espécies próximas. O resultado esperado é gerar um avanço significativo para estudos de melhoramento em peixes nativos, particularmente para um melhor entendimento das regiões genômicas associadas a características de resistência a doenças. O impacto potencial deste estudo é viabilizar tecnologias para a produção de peixes melhorados para a indústria da aquicultura.