Aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões usando os descritores estruturais de proteínas da base de dados do software STING para discriminação do sítio catalítico de enzimas

Resumo

As enzimas têm sua função determinada essencialmente por alguns resíduos específicos, denominados de resíduos catalíticos. A maioria dos métodos para a predição dos resíduos catalíticos de enzimas utiliza ao menos um critério de conservação da sequência primária. Considerando que a função é decorrente da estrutura, este projeto almeja identificar dentre os descritores estruturais disponíveis na base de dados do sofware STING, aqueles de maiorrelevância para discriminar os resíduos catalíticos. Assim, o projeto vai propor um novo método classificador para enzimas usando estes descritores como dados de entrada. Serão criados diferentes classificadores, com o objetivo de diferenciação dos resíduos do sítio catalítico para três níveis de granularidade: enzimas em geral, as seis classes de famílias de enzimas EC e famílias EC específicas. Os resultados esperados são: novos métodos para a seleção dos descritores estruturais mais importantes para o reconhecimento dos resíduos catalíticos; determinação de assinaturas de descritores específicas para grupos de enzimas, constituídas por consultas formadas pelos delimitadores inferior e superior de intervalos de valores para cada descritor selecionado; criação de "tabela periódica" das assinaturas por famílias e subfamílias protéicas; expansão do algoritmo para outros conjuntos de motifs tais como os que ligam determinados ligantes (Mg, Ca, etc.); análise estatística multivariada de dados da base de dados STING com intuito de: 1) validação do método; 2) identificação dos resíduos catalíticos das novas proteínas. (AU)