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Regulação epigenética do gene QQS (At3g30720) durante o desenvolvimento de Arabidopsis thaliana e em resposta a sinais abióticos

Processo: 11/06413-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2011
Data de Término da vigência: 31 de março de 2015
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Michel Georges Albert Vincentz
Beneficiário:Raphael Ricon de Oliveira
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:08/52071-0 - Homeostase energética e sinalização por açúcar: diversificação dos mecanismos moleculares envolvidos no controle do balanço energético em angioespermas, AP.BIOEN.TEM
Assunto(s):Epigênese genética   Desenvolvimento   Epigenômica   Arabidopsis thaliana
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Arabidopsis thaliana | At3g30720 | desenvolvimento | Qua-quine starch | regulação epigenética | Sinais abióticos | Epigenética

Resumo

Metilação de citosina e histonas H3/H4 do DNA são modificações epigenéticas importantes para inativação de elementos transponíveis (TEs), atuando como um sistema imune, e também influenciam a formação da heterocromatina e a expressão de genes. Em plantas as metilações ocorrem nas citosinas em todos os contextos de sequência, simétrico e assimétrico, sendo encontradas tanto em regiões promotoras quanto regiões transcritas (corpo do gene). O padrão de metilação é inicialmente estabelecido pela atividade "de novo" da DNA metiltransferase DRM2, em uma via dependente de componentes da maquinaria de RNAi, e mantido por duas outras metiltransferases, MET1 e CMT3. Em Arabidopsis thaliana é observada uma demetilação massiva do genoma no endosperma e nos núcleos vegetativos do pólen que reforçam o silenciamento de TEs nos gametas, porém o impacto da dinâmica de metilação do DNA sobre o desenvolvimento ainda é pouco documentado e compreendido. O gene Qua-quine Starch (QQS) é um neogene de A. thaliana localizado numa ilha heterocromática e está envolvido no controle do metabolismo de amido. Identificamos vários epialelos estáveis de QQS que apresentaram expressão dependente do grau de metilação de seu promotor e da região 5'UTR. O gene QQS também apresenta um perfil de expressão específico durante o desenvolvimento e em resposta a determinados sinais abióticos. O objetivo deste projeto é desvendar aspectos inéditos da interação entre sinais do desenvolvimento ou do meio ambiente com vias de controle de metilação do DNA usando QQS como gene marcador para estes fenômenos.

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
OLIVEIRA, R. R.; VIANA, A. J. C.; REATEGUI, A. C. E.; VINCENTZ, M. G. A.. An efficient method for simultaneous extraction of high-quality RNA and DNA from various plant tissues. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 18828-18838, . (11/06413-0)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
OLIVEIRA, Raphael Ricon de. Regulação epigenética do neogene Qua-Quine Starch durante o desenvolvimento de Arabidopsis thaliana e o impacto no metabolismo de amido. 2015. Tese de Doutorado - Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Biologia Campinas, SP.