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Análise e expressão de genes de pks ii e de carboidrases provenientes de bibliotecas metagenômicas

Processo: 11/10981-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2011
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2015
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Eliana Gertrudes de Macedo Lemos
Beneficiário:Elisângela Soares Gomes Pepe
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Assunto(s):Farmacologia   Metagenômica   Policetídeos   Expressão gênica
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:carboidrases | expressão gênica | Farmacologia | metagenômica | Pks Ii | Policetídeos | Metagenômica

Resumo

Policetídeos são variados metabólitos secundários presentes em algumas espécies de micro-organismos e plantas. Fazem parte da composição de pigmentos de esporos microbianos e de antibióticos, atuando também nos mecanismos de diferenciação fisiológica frente a fatores ambientais adversos. São sintetizados pelos complexos enzimáticos Policetídeos Síntases (PKSs I, II e III). Previamente foi realizada uma prospecção de novos "clusters" gênicos para PKSs II em uma Biblioteca Metagenômica de 9.320 clones (FAPESP, Bolsa de I.C. processo: 07/53708-0; CNPq, Bolsa de Mestrado processo: 130454/2010-9). Um inserto de DNA ambiental com 22.988 pares de bases foi encontrado, sequenciado e submetido a predição funcional de ORFs por homologia e modelagem de estrutura tridimensional in sílico. Os resultados destas análises permitiram verificar a presença de homologia para genes de transportadores ABC; PKS mínima; ciclases; aromatases; hidroxilases; mono-oxigenases; O-metil-transferases; carboidrases; peptidases; acíl-transferases; reguladores de transcrição gênica LacI e LuxR, dentre outros. Existem fortes indícios de que se trate de uma nova via de policetídeos de pigmentos. O inserto apresenta também alguns genes relacionados à degradação de carboidratos complexos (celulose/quitina/lignina). Propõe-se neste projeto de pesquisa o desenvolvimento de experimentos de expressão gênica homóloga/heteróloga para o core biossintético de PKS presente neste inserto metagenômico, além da expressão heteróloga de carboidrases de interesse industrial

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
GOMES-PEPE, ELISANGELA SOARES; MACHADO SIERRA, ELWI GUILLERMO; PEREIRA, MARIANA RANGEL; LUQUE CASTELLANE, TEREZA CRISTINA; DE MACEDO LEMOS, ELIANA GERTRUDES. Bg10: A Novel Metagenomics Alcohol-Tolerant and Glucose-Stimulated GH1 SS-Glucosidase Suitable for Lactose-Free Milk Preparation. PLoS One, v. 11, n. 12, . (11/10981-3)
MONTEIRO LIMA, NATALIA SARMANHO; GOMES-PEPE, ELISANGELA SOARES; CAMPANHARO, JOAO CARLOS; DE MACEDO LEMOS, ELIANA GERTRUDES. Broad thermal spectrum metagenomic laccase with action for dye decolorization and fentin hydroxide treatment. AMB EXPRESS, v. 12, n. 1, p. 14-pg., . (11/10981-3)
LIMA, NATALIA SARMANHO MONTEIRO; GOMES-PEPE, ELISANGELA SOARES; KOCK, FLAVIO VINICIUS CRIZOSTOMO; COLNAGO, LUIZ ALBERTO; LEMOS, ELIANA GERTRUDES DE MACEDO. Dynamics of the role of LacMeta laccase in the complete degradation and detoxification of malachite green. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 39, n. 5, p. 13-pg., . (19/23014-3, 19/20825-0, 11/10981-3)
Publicações acadêmicas
(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)
PEPE, Elisângela Soares Gomes. Análise e expressão de genes de PKS II e de carboidrases provenientes de bibliotecas metagenômicas. 2015. Tese de Doutorado - Universidade Estadual Paulista (Unesp). Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Jaboticabal Jaboticabal.