Caracterização genética de famílias de pacu (Piaractus mesopotamicus) resistentes à bactéria Aeromonas hydrophila por RNA-seq e RAD-seq

Resumo

Este estudo pretende caracterizar geneticamente famílias do peixe pacu (Piaractus mesopotamicus) resistentes à bactéria Aeromonas hydrophila. Os objetivos específicos são: 1) caracterização de genes do sistema imunológico, por técnica RNA-seq, de indivíduos suscetíveis e resistentes desafiados à infecção por A. hydrophila; 2) caracterização de QTL (Quantitative Trait Loci) associado à resistência por infecção à A. hydrophila, por seqüenciamento / genotipagem de SNPs (ddRAD-seq, double-digest restriction- site-associated DNA sequencing). Em relação ao experimento RNA-seq, após a inoculação de A. hydrophila, as análises serão realizadas nos seguintes momentos: T1 (animais com morte iminente), peixes que apresentam sinais de infecção, considerados suscetíveis; T2 (após o plateau de mortalidade), indivíduos considerados resistentes ao desafio de resistência à A. hydrophila; e T1 e T2, relacionados aos indivíduos "Controle" inoculados com solução salina (PBS). As análises de bioinformática serão realizadas a partir da montagem de novo do transcriptoma de pacu, comparando T1 x Controle, T2 x Controle e T1 x T2. Posteriormente, o sequenciamento / genotipagem será realizado pela técnica ddRAD-seq (enzimas de restrição SphI e MluCI), a fim de realizar análises moleculares de 10 famílias de pacu desafiadas com A. hydrophila, o que permitirá a busca de QTL e fornecer suporte para a seleção assistida por marcadores. O impacto potencial deste estudo é disponibilizar tecnologias viáveis para a produção de peixes melhorados para a indústria da aquicultura. (AU)