Estudo da contribuição de retrocópias na origem de novas regiões gênicas

Resumo

As retrocópias de genes codificadores foram classificadas por muito tempo como pseudogenes processados e não funcionais. Contudo, hoje sabemos que a retroduplicação gênica, o mecanismo de geração dessas retrocópias, possui um papel relevante na gênese de novos genes em humanos e em outros organismos. Entretanto, esse papel se limita a exemplos pontuais e são raros os estudos que analisam sistematicamente o papel funcional das retrocópias. Por exemplo, em humanos já foram identificadas cerca de 8.000 retrocópias de genes codificadores, das quais uma minoria (<10%) apresenta evidência de transcrição e indicadores de funcionalidade. Dois exemplos seminais são as retrocópias PTENP1 (do PTEN, um supressor tumoral) e a BRAFP1 (do gene BRAF, um proto-oncogene), as quais foram estudadas detalhadamente e tiveram suas funções evidenciadas. Atualmente, o estudo da origem de novos genes e de regiões gênicas está em ascensão graças às novas tecnologias nas diversas "ômicas", ao sequenciamento de DNA/RNA em larga escala e às ferramentas computacionais. Todo esse repertório metodológico nos fornece informações mais precisas, profundas e robustas para serem integradas e analisadas sistematicamente. Neste projeto, propomos elucidar parte do papel funcional das retrocópias através do estudo detalhado de suas contribuições para a geração de novos genes e regiões gênicas no genoma humano em condições normais e tumorais. Tal estudo será realizado por meio da análise e integração de diversos conjuntos de dados de retrocópias fixadas e polimórficas presentes no genoma humano. De maneira geral, como resultado esperamos obter um repertório mais completo sobre o papel funcional das retrocópias na origem de novos genes, regiões gênicas e, caso haja, a sua importância no processo de tumorigênese. (AU)