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Análise do Satelitoma e pintura cromossômica em variantes de cor de S. formosus e em duas outras espécies do gênero Scleropages (Teleostei, Osteoglossiformes)

Processo: 21/13180-3
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Iniciação Científica
Data de Início da vigência: 20 de abril de 2022
Data de Término da vigência: 19 de julho de 2022
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Marcelo de Bello Cioffi
Beneficiário:Gustavo Akira Toma
Supervisor: Thomas Liehr
Instituição Sede: Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). São Carlos , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Friedrich Schiller University Jena, Alemanha  
Vinculado à bolsa:18/14677-6 - Estudos cromossômicos em variantes de cor do Aruana asiático Scleropages formosus (Teleostei, Osteoglossiformes), BP.IC
Assunto(s):Citogenética   Evolução divergente   Cromossomos   Pintura cromossômica   Mapeamento cromossômico
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:cromossomos | DNAs satélites | Evolução | Pintura cromossômica | Sequenciamento NGS | Citogenética Animal

Resumo

O aluno Gustavo A. Toma está desenvolvendo seus estudos em nosso laboratório desde novembro de 2018. Até o momento, variantes de cores de S. formosus foram analisadas por métodos citogenéticos convencionais (Giemsa e bandamento C) e moleculares (mapeamento cromossômico de famílias multigênicas, CGH e Experimentos WCP) juntamente com a análise de delimitação de espécies utilizando UCEs, fornecendo dados importantes e inéditos para as suas relações evolutivas. Assim, considerando o bom andamento do projeto e o envolvimento do aluno nos experimentos, pretendemos nos aprofundar em abordagens citogenômicas, incluindo isolamento e mapeamento de satelitomas utilizando a técnica de FISH multicolor (m-FISH) e posterior microdissecção de cromossomos específicos para construir sondas. Exploraremos as divergências evolutivas diferenciais entre as variantes de cor de S. formosus e nas outras duas espécies de Scleropages com base no mapeamento cromossômico comparativo de DNAs satélites. Além disso, após o mapeamento cromossômico de toda a biblioteca satDNA, pretendemos identificar e isolar cromossomos específicos que carregam grande acúmulo de um satDNA específico. Os experimentos serão realizados no laboratório da Molekulare Zytogenetik (Universitätsklinikum Jena - Alemanha), chefiado pelo Prof. Dr. Thomas Liehr, pesquisador de importância global em microdissecção cromossômica e FISH. Os dados obtidos fornecerão dados relevantes para estimar parâmetros evolutivos diferenciais entre variantes de cores representativas e entre espécies congenéricas, resultantes do isolamento geográfico ocorrido ao longo de milhares de anos. Além dos avanços científicos esperados, esta proposta proporcionará uma oportunidade única para a formação científica do aluno, pela interação com renomado grupo de pesquisa alemã e pelo aprendizado de novas metodologias de estudo atualmente empregadas no laboratório Dr. Liehr. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TOMA, GUSTAVO A.; DOS SANTOS, NATALIA; DOS SANTOS, RODRIGO; RAB, PETR; KRETSCHMER, RAFAEL; EZAZ, TARIQ; BERTOLLO, LUIZ A. C.; LIEHR, THOMAS; PORTO-FORESTI, FABIO; HATANAKA, TERUMI; et al. Cytogenetics Meets Genomics: Cytotaxonomy and Genomic Relationships among Color Variants of the Asian Arowana Scleropages formosus. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 24, n. 10, p. 17-pg., . (21/13180-3, 18/14677-6, 20/11772-8)