Análise de variantes e polimorfismos de HPV existentes em mulheres europeias e latino-americanas

Resumo

O carcinoma cervical (CC) é o terceiro tipo de carcinoma mais comum no Brasil. O fator etiológico do CC e das lesões precursoras é a infecção persistente pelo papilomavírus humano (HPV). Existem várias maneiras de prevenir o carcinoma cervical. A prevenção primária ocorre com a vacinação. A prevenção secundária consiste no rastreamento das lesões precursoras, para as quais é realizado o exame citopatológico do colo uterino. No entanto, em alguns países desenvolvidos, o teste molecular de HPV (detecção de DNA-HPV) tem sido usado como estratégia primária de triagem. O HPV é classificado de acordo com o alto risco oncogênico (HR-HPV). Entre os tipos de alto risco, os tipos 16 e 18 se destacam. Dentro dos tipos estão diferentes variantes que têm uma relação com distribuição geográfica, patogenicidade, regulação do HPV transcrito e resposta imunológica do hospedeiro. Variantes moleculares intratípicas do HPV apresentam potencial oncogênico diferente, apesar da relação filogenética. Este estudo propõe o uso de sequenciamento de nova geração (NGS) para análise de linhagens e variantes do HPV. A genotipagem do HPV e a avaliação da variabilidade genética dos genótipos HR-HPV foram realizadas pela plataforma Ion Torrent S5 em um total de 1000 amostras divididas entre os quatro países participantes do estudo (Bélgica, Brasil, Portugal e Equador. A genotipagem foi realizado com um pipeline desenvolvido na plataforma Galaxy. Para análise de linhagem serão desenhadas algumas árvores filogenéticas para cada tipo de HPV. Para análise de polimorfismos será feita a chamada de variantes. As linhagens e polimorfismos encontrados serão analisados de acordo com dados clínicos e risco relativo de desenvolvimento de carcinoma cervical. Com este estudo, pretendemos aprimorar o conhecimento sobre as variantes e linhagens para outros tipos de HPV além dos HPV 16 e 18 presentes na população estudada e analisar se há relação entre variantes e linhagens com risco relativo de desenvolvimento de carcinoma cervical. (AU)