Otimização de ferramentas genômicas para investigar assinaturas de resistência em pacu (Piaractus mesopotamicus) à infecção por Aeromonas hydrophila

Resumo

O desenvolvimento de ferramentas genômicas será útil para o desenvolvimento contínuo da produção de espécies nativas no Brasil, maximizando o ganho genético e, consequentemente, impulsionando novos cruzamentos seletivos para essas espécies. O objetivo deste estudo é desenvolver ferramentas genômicas direcionadas à identificação de assinaturas de resistência em pacu (Piaractus mesopotamicus) a bactéria Aeromonas hydrophila com base em irmãos completos submetidos a um desafio de resistência. A análise de expressão diferencial entre fenótipos suscetíveis e resistentes será relacionada com uma análise de desequilíbrio alélico para identificar SNPs potencialmente funcionais relacionados às respostas do hospedeiro. 45 SNPs mapeados e em desequilíbrio alélico foram incluídos em um painel de SNPs de média densidade para uso na seleção genômica de populações de pacu resistentes à infecção por Aeromonas hydrophila. A maioria dos SNPs incluídos estão associados a vias responsáveis pelas defesas imunes contra Aeromonas hydrophila, e contribuirão para uma seleção genômica funcionalmente enriquecida para o controle desta infecção. Um painel de SNPs de baixa densidade foi construído e será otimizado por imputação de genótipos. Estudos de associação genômica ampla (GWAS) utilizando SNPs imputados serão realizados relacionando as regiões genômicas encontradas na análise de desequilíbrio alélico enriquecendo a avaliação da arquitetura genética da resistência de Aeromonas hydrophila em pacu. O painel de SNPs de média densidade será usado para detectar assinaturas de seleção por corridas de homozigose, usando os indivíduos desafiados. As vias e regiões genômicas que serão destacadas por este estudo são potenciais candidatas para estudos funcionais e aplicações na produção de pacu e servirão de modelo para outras espécies. (AU)