| Processo: | 22/09226-0 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 12 de maio de 2023 |
| Data de Término da vigência: | 11 de maio de 2024 |
| Área de conhecimento: | Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura |
| Pesquisador responsável: | Fábio Porto-Foresti |
| Beneficiário: | Vito Antonio Mastrochirico Filho |
| Supervisor: | José Manuel Yáñez |
| Instituição Sede: | Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil |
| Instituição Anfitriã: | Universidad de Chile, Chile |
| Vinculado à bolsa: | 20/11049-4 - Base genética para a resistência à bactéria Aeromonas hydrophila em populações de Pacu (Piaractus mesopotamicus), BP.PD |
| Assunto(s): | Melhoramento genético animal Arquitetura genética Resistência à doença Técnicas de genotipagem Polimorfismo de um único nucleotídeo |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Aeromoniose | Aquicultura sustentável | Arquitetura genética de resistência à doenças | Melhoramento genético | Painéis de genotipagem | polimorfismos de nucleotídeo único | Genética e Melhoramento Animal |
Resumo O desenvolvimento de ferramentas genômicas será útil para o desenvolvimento contínuo da produção de espécies nativas no Brasil, maximizando o ganho genético e, consequentemente, impulsionando novos cruzamentos seletivos para essas espécies. O objetivo deste estudo é desenvolver ferramentas genômicas direcionadas à identificação de assinaturas de resistência em pacu (Piaractus mesopotamicus) a bactéria Aeromonas hydrophila com base em irmãos completos submetidos a um desafio de resistência. A análise de expressão diferencial entre fenótipos suscetíveis e resistentes será relacionada com uma análise de desequilíbrio alélico para identificar SNPs potencialmente funcionais relacionados às respostas do hospedeiro. 45 SNPs mapeados e em desequilíbrio alélico foram incluídos em um painel de SNPs de média densidade para uso na seleção genômica de populações de pacu resistentes à infecção por Aeromonas hydrophila. A maioria dos SNPs incluídos estão associados a vias responsáveis pelas defesas imunes contra Aeromonas hydrophila, e contribuirão para uma seleção genômica funcionalmente enriquecida para o controle desta infecção. Um painel de SNPs de baixa densidade foi construído e será otimizado por imputação de genótipos. Estudos de associação genômica ampla (GWAS) utilizando SNPs imputados serão realizados relacionando as regiões genômicas encontradas na análise de desequilíbrio alélico enriquecendo a avaliação da arquitetura genética da resistência de Aeromonas hydrophila em pacu. O painel de SNPs de média densidade será usado para detectar assinaturas de seleção por corridas de homozigose, usando os indivíduos desafiados. As vias e regiões genômicas que serão destacadas por este estudo são potenciais candidatas para estudos funcionais e aplicações na produção de pacu e servirão de modelo para outras espécies. (AU) | |
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