Análise genômica de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: identificação taxonômica e caracterização de genes relacionados à síntese de bacteriocinas

Resumo

Este estudo visa realizar a análise genômica de linhagens bacterianas probióticas produtoras de bacteriocinas, isoladas a partir de amostras da microbiota intestinal de frangos de corte (Gallus gallus domesticus) linhagem Cobb, suínos (Sus scrofa domesticus) mestiços das raças Landrace e Large white e peixes (tilápia-do-nilo, Oreochromis niloticus, e truta-arco-íris, Oncorhynchus mykiss). Para isso, serão realizados os seguintes objetivos especificos: (1) Realizar o sequenciamento genomico após o isolamento e a caracterização fenotípica de linhagens de Bacilos acido lacticos (BALs) produtoras de bacteriocinas. (2) Realizar a genomica comparativa pela análise filogenetica do 16S rRNA e do sequence type (MLST) obtidos in silico. (3) Realizar a identificação de genes de bacteriocinas através do uso de diferentes bancos de dados e ferramentas de bioinformática como AntiSMASH, BACTIBASE, BAGEL , BOA e NeuBI. Espera-se descobrir novas variantes de bacteriocinas e sua respectiva associação com determinadas linhagens, espécies e nichos ecológicos. Uma vez que as linhagens estejam genomicamente caracterizadas, o projeto visa contribuir para o desenvolvimento racional de suplementações probióticas destinadas a animais de produção.