Sequenciamento e Bioinformática de Anfíbios e seus Patógenos

Resumo

O projeto temático relacionado deverá coletar anfíbios diversos, em uma grande região do território nacional, e eventualmente fora do Brasil. Em muitos casos a identificação dos espécimes é complexa e, assim, faz-se necessária a utilização de ferramentas moleculares (DNA Barcoding) como uma forma de determinação específica. Isto torna-se ainda mais complexo no caso de girinos, que geralmente são coletados, mas muitos permanecem sem identificação. Esta é complementar à outras técnicas, como morfometria e bioacústica, mas demanda conhecimento técnico especializado - tanto na prática de bancada de laboratório (extração, amplificação e eventualmente sequenciamento), como na operação dos softwares específicos (bioinformática). Além disso, o posicionamento dos indivíduos em filogenias pode revelar novas espécies - em consonância com um dos objetivos deste projeto (taxonomia). Outro ponto importante é o sequenciamento e genotipagem das linhagens do fungo Bd e do ranavirus. Assim, o bolsista irá realizar as análises moleculares de todo material a ele direcionado pelos membros da equipe do temático. Este deverá retornar com a identificação molecular, ou indicação da necessidade de maiores análises complementares. Este projeto deve beneficiar todos os subprojetos do temático associado.