Bolsa 22/11119-8 - Anfíbios, Conservação - BV FAPESP
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Análise da diversidade e função da microbiota ambiental e sua relação com os anfíbios

Processo: 22/11119-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2023
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2024
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Ecologia - Ecologia Aplicada
Pesquisador responsável:Célio Fernando Baptista Haddad
Beneficiário:Ananda Brito de Assis
Supervisor: Carlos Guilherme Becker
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
Instituição Anfitriã: Pennsylvania State University, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:21/02414-3 - Efeito da desconexão de hábitats sobre o microbioma terrestre na Floresta Atlântica e consequências para a imunidade de anfíbios, BP.PD
Assunto(s):Anfíbios   Conservação   Patógenos   Ecologia da paisagem   Microbioma gastrointestinal
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Anfíbios | Conservação | Microbioma ambiental | Microbioma animal | patógenos | Ecologia da Paisagem

Resumo

Anfíbios são particularmente vulneráveis às mudanças ambientais e às doenças infecciosas. Eles estão associados à microrganismos produtores de moléculas bioativas, os quais atuam como uma barreira contra a colonização de patógenos. Variações na estrutura da comunidade microbiana da pele dos anfíbios, e em seus metabólitos (i.e., o microbioma), podem influenciar diretamente a habilidade, de cada indivíduo, de evitar ou reduzir a severidade de infecções patogênicas. Essa microbiota associada provavelmente depende da dinâmica das comunidades microbianas do hábitat. O objetivo desta pesquisa é analisar as comunidades microbianas ambiental e a associada aos anfíbios, em relação à diversidade, composição e função anti-patógeno. Também será avaliada a prevalência do patógeno Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) ao longo das paisagens focais. Testaremos as hipóteses propostas na pesquisa original de pós-doutorado, sobre a relação entre a conectividade do hábitat e as comunidades microbianas relacionadas aos anfíbios. Usaremos ferramentas moleculares e genéticas emergentes, tais como, o sequenciamento de alto desempenho do gene 16S rRNA, para analisar a composição e a diversidade bacteriana do solo e de anfíbios; e PCR digital para aprimorar nossa habilidade de detecção, mesmo a baixas concentrações, do patógeno Bd no ambiente. Também faremos bioensaios para testar a função anti-Bd de bactérias isoladas do solo e de anfíbios. As cepas com atividade inibitória do Bd serão identificadas taxonomicamente e incorporadas a uma coleção de mais de 4.000 cepas bacterianas de anfíbios já testadas. Este estudo irá contribuir para o entendimento da influência ambiental sobre o recrutamento do microbioma anfíbios e sua interação com patógenos. (AU)

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