O uso da genotipagem por sequenciamento direcionado (tGBS) para seleção genética de bovinos Nelore

• Processo: 18/06992-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2018
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2019
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Daniel Robert Arnold
• Beneficiário: Daniel Robert Arnold
• Empresa: VRGEN Laboratório de DNA Ltda
• CNAE: Criação de bovinos ; Atividades de apoio à agricultura
• Município: Araçatuba
• Pesquisadores associados: Flavia Lombardi Lopes
• Bolsa(s) vinculada(s): 18/25678-3 - O uso da genotipagem por sequenciamento direcionado (tGBS) para seleção genética de bovinos Nelore, BP.PIPE
• Assunto(s): Seleção genética Seleção animal Análise de sequência de DNA Técnicas de genotipagem Polimorfismo de um único nucleotídeo Bovinos Gado Nelore
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cattle | Genetic selection | Genotyping by Sequencing | Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) | seleção animal

Resumo

A crescente indústria pecuária brasileira está constantemente buscando novas maneiras de melhorar a produção. Com os avanços das biotecnologias, os produtores de gado agora são capazes de implementar a seleção genética assistida por marcadores moleculares em seus rebanhos, visando produzir animais superiores e mais eficientes. Ao usar marcadores moleculares, como nucleotídeos de polimorfismo único (SNPs), os produtores podem selecionar quais animais carregam os SNPs associados às características fenotípicas que desejam. Na última década, os pecuaristas brasileiros começaram a adotar essa tecnologia. Embora seja necessária a criação de um banco de dados genotípico/fenotípico, através da triagem de centenas de milhares de SNPs de uma raça ou rebanho, o custo de se rastrear todos os animais pela tecnologia de chip array é proibitivo. No entanto, uma nova tecnologia está começando a surgir no mercado, chamada de genotipagem por sequenciamento direcionada (targeted genotyping by sequencing; tGBS). O tGBS direcionado permite a triagem de SNPs selecionados que são mais importantes para as características de interesse. Uma vez que o produtor ou a associação da raça tenha estabelecido quais SNPs são mais importantes para as características desejadas, um painel personalizado de tGBS pode ser estabelecido. As vantagens do tGBS são a triagem especifica dos SNPs de interesse (personalizados), resultados mais rápidos, fornecer mais informações genéticas a um custo menor, o que permitiria aos produtores rastrear uma porcentagem elevada, ou a té a totalidade de seu rebanho. Esta tecnologia já foi estabelecida para o rastreio do câncer em humanos e seleção genética de plantas, mas ainda não atingiu a indústria pecuária. O projeto proposto é determinar a precisão, consistência e qualidade de imputação para a seleção genética de painéis tGBS de 2.000 e 5.000 SNPs contra a tecnologia de chip disponível atualmente no mercado para bovinos. Ao estabelecer a tecnologia tGBS como uma alternativa confiável, mais rápida e barata, mais produtores brasileiros poderão ampliar o uso da seleção genética em suas fazendas para continuar o reinado do Brasil como líder mundial na produção de gado. (AU)