Desenvolvendo e aplicando métodos de simulação computacional para melhorar a compreensão molecular para a engenharia de biomateriais funcionalizados

• Processo: 20/07158-2
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2025
• Área do conhecimento: Engenharias - Engenharia Biomédica
• Acordo de Cooperação: ANR
• Pesquisador responsável: Fernando Luis Barroso da Silva
• Beneficiário: Fernando Luis Barroso da Silva
• Pesquisador Responsável no exterior: ETCHEBEST
• Instituição Parceira no exterior: Université Paris Diderot - Paris 7, França
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Alexandre de Brevern ; Frédéric Guyon ; Jean-Christophe Gelly ; Julien Diharce
• Assunto(s): Moléculas bioativas Interações biomoleculares Interação proteína-proteína Anticorpos Simulação de dinâmica molecular Método de Monte Carlo Interações eletrostáticas Técnicas de diagnóstico molecular Simulação por computador
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: desenho de anticorpos | Diagnóstico biomolecular | Dinâmica Molecular | Interação proteína-proteína | interações eletrostáticas | Monte Carlo | Engenharia de biomoléculas

Resumo

O tema central aqui é a engenharia de novos materiais biomoleculares. Um aspecto essencial é a compreensão e controle das interações biomoleculares, particularmente a dependência do pH. Este tópico é altamente desafiador e extremamente importante em muitos bioprocessos. Com base na nossa experiência conjunta e no desenvolvimento de novos métodos teóricos, queremos aumentar o conhecimento das interações físicas fundamentais responsáveis pela formação e estabilidade de complexos moleculares como base para a compreensão, diagnóstico e tratamento de doenças; desenvolvimentos nas indústrias farmacêutica e alimentícia; design de novos materiais (bio)funcionalizados e processos de bioseparação em geral. Os sistemas estudados incluirão proteínas de flavivírus e relacionadas com o SARS-CoV-2, e o desenho de novos anticorpos devido à sua importância para a saúde global. Nossa proposta se beneficia de nossa expertise em simulações computacionais, modelos eletrostáticos e do profundo conhecimento da dinâmica e interações biomoleculares. (AU)

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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PRATES-SYED, WASIM A.; CHAVES, LORENA C. S.; CREMA, KARIN P.; VUITIKA, LARISSA; LIRA, ALINE; CORTES, NELSON; KERSTEN, VICTOR; GUIMARAES, FRANCISCO E. G.; SADRAEIAN, MOHAMMAD; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.; et al. LP-Based COVID-19 Vaccines: An Adaptable Technology against the Threat of New Variant. VACCINES, v. 9, n. 12, DEC 2021. (20/05146-7, 20/07158-2, 17/10910-5, 19/14526-0)

LUNKAD, RAJU; BARROSO DA SILVA, FERNANDO L.; KOSOVAN, PETER. Both Charge-Regulation and Charge-Patch Distribution Can Drive Adsorption on the Wrong Side of the Isoelectric Point. Journal of the American Chemical Society, v. 144, n. 4, p. 13-pg., 2022-01-20. (20/07158-2)

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