Vigilância e epidemiologia molecular dos Bocavirus humanos associados à gastroenterite aguda

• Processo: 20/14786-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Adriana Luchs
• Beneficiário: Adriana Luchs
• Instituição Sede: Instituto Adolfo Lutz (IAL). São Paulo , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Paulo
• Pesquisadores associados: Antonio Charlys da Costa ; HUGO REIS RESQUE ; Luana da Silva Soares Farias ; Marcelle Figueira Marques da Silva Sales
• Bolsa(s) vinculada(s): 21/09064-8 - Vigilância e epidemiologia molecular dos Bocavírus humanos associados à gastroenterite aguda, BP.TT
• Assunto(s): Virologia Epidemiologia molecular Vigilância epidemiológica Doenças respiratórias Gastroenterite Bocavirus humano Reação em cadeia da polimerase em tempo real Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bocaparvovírus humano | Epidemiologia Molecular | Gastroenterite | pcr em tempo real | sequenciamento | Vigilância Epidemiológica | Virologia

Resumo

O Bocaparvovírus humano (HBoV) foi descrito em 2005, durante um estudo que visava investigar a presença de agentes etiológicos envolvidos em infecções respiratórias em crianças hospitalizadas na Suécia. Há 4 genótipos de HBoV identificados até o momento. HBoV-1 é comumente associado as infecções respiratórias, enquanto o HBoV-2, HBoV-3 e HBoV-4 são frequentemente detectados em amostras fecais. HBoV apresenta distribuição global e estudos epidemiológicos em todo o mundo confirmam sua importância como agente etiológico tanto associado à doença diarreica quanto à doença respiratória. A prevalência mundial do HBoV varia de 1% a 56,8% em amostras de secreção respiratória e de 1,3% a 63% em espécimes fecais. Coinfecções envolvendo o HBoV e outros agentes virais respiratórios e entéricos são frequentes. No Brasil, a primeira detecção de HBoV ocorreu em 2007 em amostras fecais de crianças com gastroenterite aguda. Entretanto, ainda pouco se sabe sobre a incidência dos HBoV tanto em associação com doença diarreica e quanto a quadros respiratórios no país. Um aumento na frequência de vírus emergentes associados a quadros diarreicos e respiratórios vem sendo observado nos últimos anos, acarretando a necessidade de melhorar a acuidade da vigilância epidemiológica e laboratorial para estes agentes. O presente projeto se propõe a descrever a ocorrência de HBoV em secreções respiratórias e amostras fecais de pacientes em atendimento ambulatorial e identificar os genótipos de HBoV associados aos respectivos agravos, visando estabelecer o papel e o impacto dos HBoV como agentes causadores de doenças respiratórias e diarreicas no Brasil. Ainda, propõe determinar a frequência e a distribuição espaço-temporal dos HBoV no Brasil em pacientes com gastroenterite aguda. Este estudo será dividido em duas fases. A Fase 1 visa reconhecer a relação causal entre genótipos de HBoV e agravo respiratório/gastroentérico associado. Nessa fase serão analisadas amostras de secreção respiratória e espécime fecal (pareadas) de pacientes de ambos os sexos em diferentes faixas etárias no período de janeiro a dezembro de 2021, atendidos em ambulatórios da região metropolitana de Belém, Pará. Haverá coleta de pacientes que apresentem sintomas sugestivos de infecção respiratória e/ou gastroenterite aguda, assim como indivíduos assintomáticos para esses agravos. A Fase 2 visa definir a prevalência dos genótipos de HBoV no Brasil em relação ao espaço e ao tempo. Essa fase compreenderá um estudo retrospectivo conduzido com amostras fecais provenientes da vigilância nacional dos rotavírus coletadas entre os anos de 1998 e 2018. As amostras incluídas no estudo serão testadas para HBoV por PCR em tempo real (qPCR) tendo como alvo o gene que codifica para a proteína NS1. A genotipagem das amostras positivas de HBoV será realizada por PCR convencional com alvo para os genes VP1/2, seguido de sequenciamento gênico. Amostras positivas para HBoV representativas (~10%) de todo o período de estudo serão selecionadas para a realização da análise filogenética e evolutiva. Este é um estudo pioneiro no país. O presente estudo proporcionará ampliar o conhecimento epidemiológico das infecções causadas pelos HBoV, assim como sua diversidade genética. Os dados obtidos com o presente estudo também irão contribuir para o melhor entendimento sobre o papel dos HBoV nos quadros de gastroenterite no país após a introdução da vacinação contra o rotavírus, assim como em amostras históricas coletadas antes de sua descrição em 2005. Ao disponibilizar as sequências genômicas dos HBoV nos bancos de dados de anotações de sequências de nucleotídeos publicamente disponíveis, espera-se que a presente investigação também possa auxiliar no planejamento estratégico de controle da doença frente a uma emergência inesperada, assim como na capacidade de estabelecer conexões epidemiológicas mais consistentes. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CUNHA, LIA; LUCHS, ADRIANA; AZEVEDO, LAIS S. S.; SILVA, VANESSA C. M.; LEMOS, MARCILIO F. F.; COSTA, ANTONIO C. C.; COMPRI, ADRIANA P. P.; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; MALTA, FERNANDA; et al. Detection of Hepatitis E Virus Genotype 3 in Feces of Capybaras (Hydrochoeris hydrochaeris) in Brazil. Viruses-Basel, v. 15, n. 2, p. 13-pg., 2023-02-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)

ADRIANA LUCHS; LAIS SAMPAIO DE AZEVEDO; ELLEN VIANA DE SOUZA; ROBERTA SALZONE MEDEIROS; YASMIN FRANÇA VIANA PIRES DE SOUZA; DALANE LOUDAL FLORENTINO TEIXEIRA; THIAGO FRANCO DE OLIVEIRA CARNEIRO; GABRIELA MARIA FERNANDES DE ALENCAR; FERNANDA LÚCIA DE SOUSA LEITE MORAIS; DIANA DE FÁTIMA ALVES PINTO; et al. Coxsackievirus A6 strains causing an outbreak of hand-foot-and-mouth disease in Northeastern Brazil in 2018. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 64, 2022-02-21. (20/11182-6, 19/21706-5, 20/14786-0, 17/00021-9, 20/02469-0)

FRANCA, YASMIN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; VIANA, ELLEN; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; GUIDUCCI, RAQUEL; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA. Genetic diversity and evolution of G12P[6] DS-1-like and G12P[9] AU-1-like Rotavirus strains in Brazil. FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS, v. 24, n. 3, p. 40-pg., 2024-06-01. (20/11182-6, 17/50333-7, 20/02469-0, 20/14786-0, 22/02529-8, 21/09064-8, 15/12944-9)

DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; SILVA, VANESSA CRISTINA MARTINS; GUIDUCCI, RAQUEL; GUADAGNUCCI, SIMONE; COSTA, FERNANDA FARIA; GHANI, MONIQUE BEERENS ABDUL; LOPES, RICARDO DUARTE; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; CUNHA, LIA; LEMOS, MARCILIO FIGUEREDO; et al. Emerging zooanthroponotic risks: Detection of the human norovirus GII.4 Sydney[P31] strain in a domestic dog in Brazil. Acta Tropica, v. 260, p. 6-pg., 2024-12-01. (20/14786-0, 17/50333-7, 15/12944-9)

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AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; COSTA, FERNANDA FARIA; GHANI, MONIQUE BEERENS ABDUL; VIANA, ELLEN; FRANCA, YASMIN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; GUIDUCCI, RAQUEL; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; PRIMO, DIELI; LOPES, RICARDO DUARTE; et al. Full genotype characterization of Brazilian canine G3P[3] strains during a 10-year survey (2012-2021) of rotavirus infection in domestic dogs and cats. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 168, n. 7, p. 15-pg., 2023-07-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)

DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; GUIDUCCI, RAQUEL; RIBEIRO, CIBELE DANIEL; VIEIRA, HELOISA ROSA; BARRIO-NUEVO, KAROLINA MORALES; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Lack of molecular evidence of fecal-borne viruses in capybaras from Sao Paulo state, Brazil, 2018-2020: a minor public health issue. Brazilian Journal of Microbiology, v. N/A, p. 9-pg., 2022-11-07. (20/14786-0, 20/02469-0, 15/12944-9, 20/11182-6, 19/21706-5)

RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO FORO; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; BRUSTULIN, RAFAEL; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; PANDEY, RAMENDRA PATI; RAJ, V. SAMUEL; DENG, XUTAO; DELWART, ERIC; et al. Composition of Eukaryotic Viruses and Bacteriophages in Individuals with Acute Gastroenteritis. Viruses-Basel, v. 13, n. 12, DEC 2021. (20/14786-0, 15/12944-9, 17/00021-9)

FURUSATO, ISABELLA NAOMI; FIGUEIREDO, KETLYN BOLSACHINI; DE CARVALHO, ANA CAROLINA SOUZA RAMOS; FERREIRA, CAMILA SANTOS DA SILVA; TAKAHASHI, JULIANA POSSATTO FERNANDES; KIMURA, LIDIA MIDORI; ALEIXO, CAMILA SIQUEIRA; DE BRITO, ODILIA PEREIRA; LUCHS, ADRIANA; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Detection of herpesviruses in neotropical primates from Sao Paulo, Brazil. Brazilian Journal of Microbiology, v. N/A, p. 9-pg., 2023-09-09. (17/50333-7, 20/14786-0)

MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; GUIDUCCI, RAQUEL; DE LIMA NETO, DANIEL FERREIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; LUCHS, ADRIANA. Genomic Constellation of Human Rotavirus G8 Strains in Brazil over a 13-Year Period: Detection of the Novel Bovine-like G8P[8] Strains with the DS-1-like Backbone. Viruses-Basel, v. 15, n. 3, p. 34-pg., 2023-03-01. (20/02469-0, 15/12944-9, 20/14786-0, 20/11182-6)