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Construção e caracterização de micro-reatores da proteína clorocatecol 1,2-dioxigenase que utilizam domínios de baixa complexidade como adesivos moleculares

Processo: 20/15542-7
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de julho de 2021
Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Antonio José da Costa Filho
Beneficiário:Antonio José da Costa Filho
Instituição Sede: Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Pesquisadores associados:Ana Paula Ulian de Araujo ; Eduardo Festozo Vicente
Bolsa(s) vinculada(s):22/07049-4 - Expressão, purificação e caracterização de enzimas quimera, BP.TT
21/08956-2 - Expressão, purificação e caracterização de enzimas quimera, BP.TT
Assunto(s):Interações biomoleculares  Domínios de baixa complexidade  Agregados proteicos  Enzimas  Quimera  Extração líquido-líquido  Espectroscopia 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:agregados protéicos | Domínios de baixa complexidade | enzima | Espectroscopia | separação de fase líquido-líquido | Biofísica de interações moleculares

Resumo

Domínios de baixa complexidade (LCDs) são sequências de resíduos de aminoácidos com características estruturais peculiares e ainda pouco exploradas dentro da bioquímica e biofísica molecular. Sua dinâmica de interação é pouco conhecida, bem como suas funções, toxicidade e persistência durante a evolução. Sabe-se, porém, que, se usados como adesivos moleculares em proteínas (chamadas, então, de proteínas quimera), os LCDs são capazes de promover separação de fases (aglomerados), como em gotículas (separação de fase líquido-líquido) ou em fase sólida (agregados irreversíveis). Estas fases formadas por quimeras podem ter suas superfícies químicas controladas, mantendo as propriedades físicas/químicas da proteína original. Essa estratégia permite uma quantidade grande de aplicações, como em engenharia de alimentos e de tecidos, desenvolvimento de vacinas, biossensores, engenharia de alimentos, dentre outras. Neste projeto, propomos o uso da enzima clorocatecol 1,2-dioxigenase (1,2-CCD), que atua na degradação de compostos policíclicos aromáticos e, portanto, com potencial uso em mecanismos de biorremediação, como caso de estudo para fabricação de micro-reatores enzimáticos constituídos por enzimas quimeras contendo LCDs. Como processo controle, usaremos a produção de proteínas quimera da Green Fluorescent Protein e LCDs, sistema já mostrado na literatura como formador de fase líquido separada. A enzima 1,2-CCD será expressa e purificada com LCDs ligados a suas regiões N- e C-terminais, sendo tais LCDs derivados de sequências de baixa complexidade reportadas previamente na literatura e que se mostraram capazes de induzir separação de fase líquido-líquido. Para caracterizar as proteínas quimera, usaremos calorimetria diferencial de varredura (DSC), dicroísmo circular (CD) e medida da atividade enzimática. Para monitorar o processo de separação de fases, as técnicas de microscopia e de espalhamento de luz serão empregadas. Esperamos que o agregado formado por separação de fase da proteína quimera tenha potencial uso na degradação de compostos aromáticos e que o estabelecimento com sucesso do know how na produção de micro-reatores por separação de fase líquido-líquido possa ser estendido a outras enzimas com potencial aplicação biotecnológica. (AU)

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Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MENDES, LUIS FELIPE S.; COSTA-FILHO, ANTONIO J.. A gold revision of the Golgi Dynamics (GOLD) domain structure and associated cell functionalities. FEBS Letters, v. 596, n. 8, p. 18-pg., . (17/24669-8, 20/15542-7, 15/50366-7, 21/10465-7)
ALVAREZ, NATALIA; FREDDI, PRISCILLA; CASTELLANI, STEPHANIE; VEIGA, NICOLAS; FACCHIN, GIANELLA; COSTA-FILHO, ANTONIO J.. New Insights into the Biophysical Behavior of an Old Molecule: Experimental and Theoretical Studies of the Interaction Between 1,10-Phenanthroline and Model Phospholipid Membranes. Brazilian Journal of Physics, v. 52, n. 4, p. 8-pg., . (15/50366-7, 20/15542-7)
MENDES, LUIS FELIPE S.; GIMENES, CAROLINA O.; DA SILVA, MARILIA D. O.; ROUT, SAROJ K.; RIEK, ROLAND; COSTA-FILHO, ANTONIO J.. The potential role of liquid-liquid phase separation in the cellular fate of the compartments for unconventional protein secretion. Protein Science, v. 33, n. 7, p. 16-pg., . (22/06006-0, 15/50366-7, 09/54044-3, 21/10465-7, 20/15542-7)
EVANGELISTA, NATHAN N.; MICHELETTO, MARIANA C.; KAVA, EMANUEL; MENDES, LUIS F. S.; COSTA-FILHO, ANTONIO J.. Biomolecular condensates of Chlorocatechol 1,2-Dioxygenase as prototypes of enzymatic microreactors for the degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons. International Journal of Biological Macromolecules, v. 270, p. 9-pg., . (17/24669-8, 20/01152-2, 18/13016-6, 15/50366-7, 21/10795-7, 20/15542-7)