Desenvolvimento de um chip de DNA para o incremento da produtividade em cativeiro de garoupa-verdadeira: uma importante espécie marinha da costa brasileira

• Processo: 21/03822-8
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Acordo de Cooperação: Programa FINEP – TECNOVA II
• Pesquisador responsável: Priscilla Marqui Schmidt Villela
• Beneficiário: Priscilla Marqui Schmidt Villela
• Empresa: Ecomol Consultoria e Projetos Ltda. - ME
• CNAE: Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais ; Atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente
• Município: Amparo
• Pesquisadores associados: Alexandre Wagner Silva Hilsdorf ; Claudia Ehlers Kerber
• Auxílio(s) vinculado(s): 21/08317-0 - Desenvolvimento de um chip de DNA para o incremento da produtividade em cativeiro de garoupa-verdadeira: uma importante espécie marinha da costa brasileira, AP.PIPE
• Assunto(s): Genômica Melhoramento genético Melhoramento genético animal Polimorfismo de um único nucleotídeo Maricultura Criação em cativeiro Garoupa Epinephelus marginatus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aquicultura | Aquicultura Garoupa | Chip DNA SNPs | garoupa-verdadeira | Melhoramento genético | Seleção SNPs para produtividade | Genômica Animal

Resumo

A garoupa-verdadeira (Epinephelus marginatus) é um peixe marinho conhecido por sua ampla distribuição geográfica. Pertence à subfamília Epinephelidae, da qual diversas espécies apresentam elevado desempenho produtivo, especialmente na Ásia. Devido ao interesse na comercialização de sua carne, populações naturais de garoupa-verdadeira vêm sofrendo depleção há muitos anos, o que fez com que a espécie fosse classificada como vulnerável pela União Internacional para Conservação da Natureza e incluída no Livro Vermelho da Fauna Brasileira Ameaçada de Extinção. Embora diversas publicações científicas visem à conservação da espécie, pouco avanço tem sido feito no desenvolvimento da aquicultura para a garoupa-verdadeira. Uma vez que a produção em cativeiro de indivíduos com características de interesse econômico é um potencial instrumento para redução da depleção de estoques pesqueiros naturais, a presente proposta visa gerar os subsídios aplicados e práticos para futuros programas de melhoramento genético da garoupa-verdadeira. O principal objetivo a ser alcançado consiste no estabelecimento de uma população-fundadora geneticamente diversa que garanta cruzamentos em longo prazo evitando a depressão por endogamia. Para tanto, indivíduos de populações naturais ao longo da costa brasileira serão coletados e transportados até as dependências da Redemar Alevinos, empresa parceira com extensa experiência na criação em cativeiro de garoupa-verdadeira. Em seguida, fragmentos de nadadeiras caudais de aproximadamente 150 indivíduos de localidades diferentes serão coletados para extração de DNA na empresa EcoMol Consultoria e Projetos, que realizará o sequenciamento do genoma e as análises de GBS (Genotyping-by-Sequencing) para identificar os chamados 'polimorfismos de ponto único' (Single Nucleotide Polymorfisms - SNPs) nos indivíduos. Os resultados dessa primeira etapa culminarão na seleção de determinado número de SNPs para desenvolvimento de um painel informativo a ser testado no presente plantel de reprodutores da RedeMar e dos animais que serão coletados para compor a população base de reprodutores da empresa. Esse painel de SNPs selecionados será então utilizado para compor um chip de DNA para genotipagem automatizada na plataforma microfluídica Fluidigm Juno System/EP1 (System nanofluidic Dynamic Array Chip technology, Fluidigm Corp). O desenvolvimento desse chip irá facilitar a seleção precoce de indivíduos de garoupa-verdadeira geneticamente superiores. Desse modo, espera-se com essa iniciativa que o setor de aquicultura dessa espécie com elevado potencial possa se desenvolver com maior velocidade como atividade econômica, e que haja ao mesmo tempo, uma redução considerável da pesca em populações selvagens para abastecimento do mercado. Os benefícios a serem atingidos com a presente proposta visam não apenas o desenvolvimento econômico das duas empresas parceiras, mas sim de todo um setor da maricultura que se encontra ainda subestimado no Brasil. (AU)