Metatranscriptoma e resistoma microbiano em abscesso apical agudo

• Processo: 21/14434-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2022
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2024
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Odontologia - Endodontia
• Pesquisador responsável: Ericka Tavares Pinheiro
• Beneficiário: Ericka Tavares Pinheiro
• Instituição Sede: Faculdade de Odontologia (FO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Lamprini Karygianni
• Assunto(s): Tratamento do canal radicular Infecção endodôntica Abscesso periapical Citocinas Resistência microbiana a medicamentos Metagenoma Metatranscriptômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Abscesso Apical Agudo | citocinas | infecção dos canais radiculares | metagenoma | Metatranscriptoma | resistoma | Endodontia

Resumo

Embora a metatranscriptômica (análise coletiva da expressão gênica) tenha sido aplicada com sucesso ao estudo de cáries e doenças periodontais, ela ainda não foi aplicada à análise funcional do microbioma em doenças endodônticas. O abscesso apical agudo é a forma mais grave de doença endodôntica. Em alguns casos, o abscesso dentoalveolar pode se espalhar para outras áreas da cabeça e do pescoço e causar complicações graves com risco de vida. No entanto, as causas da gravidade das doenças endodônticas permanecem desconhecidas. Os antibióticos são geralmente indicados para o tratamento urgente do abscesso apical agudo com envolvimento sistêmico. Cepas bacterianas resistentes têm sido relatadas em casos com evolução séptica, evidenciando o crescente desafio para o tratamento das infecções odontogênicas graves. Recentemente, a metagenômica (análise coletiva de material genético) expandiu o conhecimento do resistoma (genes coletivos de resistência aos antimicrobianos) em diversos ambientes. No entanto, até o momento, nenhum estudo usou a metagenômica para explorar o resistoma microbiano em doenças endodônticas. Objetivos: Os objetivos deste estudo são: (a) investigar a composição das comunidades microbianas ativas e suas funções no abscesso apical agudo e na periodontite apical assintomática (controle); (b) explorar a resposta do hospedeiro às atividades microbianas em infecções endodônticas; e (c) explorar o resistoma microbiano em doenças endodônticas. Métodos: O sequenciamento metagenômico e metatranscriptômico será realizado em amostras de abscesso apical agudo e periodontite apical assintomática (controle) utilizando Illumina. Um total de 20 pares de metatranscriptoma e metagenoma serão comparados para avaliar a composição taxonômica e funcional do microbioma em doenças endodônticas. Esses dados serão correlacionados com o perfil inflamatório dos tecidos apicais, que serão avaliados pelo Human Cytokine Magnetic 30 - Plex Panel (Novex, ThermoFisher Scientific, Waltham, EUA). Dados de sequenciamento também serão usados para detectar a coleção de genes de resistência nas amostras. (AU)