Análise genômica de linhagens pandêmicas de Escherichia coli patogênicas aviárias (APEC) com vistas ao monitoramento da Colibacilose Aviária no Brasil

• Processo: 22/11917-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2025
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Patologia Animal
• Pesquisador responsável: Terezinha Knöbl
• Beneficiário: Terezinha Knöbl
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: André Becker Simões Saidenberg
• Assunto(s): Doenças das aves Escherichia coli patogênica aviária Avicultura Colibacilose animal Tipagem de sequências multilocus Genômica Brasil
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Apec | Avicultura | Colibacilose aviária | Doenças bacterianas | Mlst | Ornitopatologia | Ornitopatologia

Resumo

Escherichia coli patogênica aviária (APEC) é o agente etiológico da colibacilose, doença extra intestinal que causa perdas econômicas significativas na indústria avícola. Determinados grupos clonais pandêmicos têm sido relacionados aos surtos de colibacilose aviária, e também a ocorrência de infecções em humanos, pois as cepas aviárias compartilham fatores de virulência com os patotipos causadores de infecções urinárias (UPEC), meningite (MNEC) e sepse (SEPEC). O potencial zoonótico tem sido estudado em modelos experimentais e resultam na inespecificidade de hospedeiros, reforçando a hipótese de transmissão alimentar de APEC. A retirada dos antimicrobianos como aditivos melhoradores de desempenho representou um enorme desafio ao setor, particularmente no controle de infecções causadas por enterobactérias. No ano de 2019, muitos produtores relataram aumento da mortalidade inicial e das condenações de carcaças nos abatedouros, com lesões de colibacilose aviária. Pesquisas baseadas no sequenciamento do genoma de APEC têm auxiliado vários países no mundo a estabelecer as linhagens de APEC de maior importância epidemiológica, facilitado o controle por meio da utilização de vacinas. No Brasil, estes dados são muito escassos. O objetivo deste projeto é realizar um levantamento epidemiológico das linhagens pandêmicas circulantes no Brasil por meio do sequenciamento do genoma total (WGS). Serão avaliadas 250 estirpes de APEC, procedentes de dos cinco estados com maior produção de aves (RS, PR, SC, SP e MG), isoladas no período de 2018 a 2022. Os isolados serão triados por PCR, para determinação dos fatores de virulência e dos grupos filogenéticos, e o agrupamento clonal será realizado pela técnica de AFLP. Após a triagem, serão selecionadas 50 estirpes, representativas de diferentes clados e perfis de virulência, para o sequenciamento de genoma total. A análise in sílico destes isolados vai determinar os sorogrupos e tipos de sequencias (STs), as características genotípicas e filogenéticas, incluindo-se os padrões mais recentes de aquisição de determinantes emergentes de resistência antimicrobiana e de virulência entre os grupos. A análise também permitirá uma comparação com as sequencias mundiais disponíveis de APEC, depositadas em bancos de dados. Os resultados trarão uma melhor compreensão sobre a epidemiologia destas APEC e contribuirão para o controle de clones de alto risco. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SAIDENBERG, A. B. S.; EDSLEV, S. M.; HALLSTROM, S.; RASMUSSEN, A.; PARK, D. E.; AZIZ, M.; QUEIROZ, B. DOS SANTOS; BAPTISTA, A. A. S.; BARBOSA, F.; ROCHA, V. G. P.; et al. Escherichia coli ST117: exploring the zoonotic hypothesis. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. 12, n. 10, p. 15-pg., 2024-09-05. (22/11917-1)