Desenvolvimento e aplicação de protocolo de DNA ambiental (e-DNA) como método rápido, preciso e não invasivo para o monitoramento da ictiofauna de água doce

• Processo: 23/11450-9
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Pesquisa Inovativa em Pequenas Empresas - PIPE
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2024
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2026
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Recursos Pesqueiros de Águas Interiores
• Pesquisador responsável: André Batista Nobile
• Beneficiário: André Batista Nobile
• Empresa: Ictiológica Consultoria Ambiental Ltda. - ME
• CNAE: Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais
• Município: Botucatu
• Pesquisadores principais: Felipe Pontieri de Lima
• Pesquisadores associados: Claudio de Oliveira
• Vinculado ao auxílio: 21/13994-0 - Desenvolvimento e aplicação de protocolo de DNA ambiental (e-DNA) como método rápido, preciso e não invasivo para o monitoramento da ictiofauna de água doce, AP.PIPE
• Bolsa(s) vinculada(s): 25/05742-2 - Aprimoramento de protocolo de filtragem de água e extração de DNA para estudos de DNA ambiental, BP.TT; 24/19319-1 - Aprimoramento de protocolo de filtragem de água e extração de DNA para estudos de DNA ambiental, BP.TT; 24/01719-3 - Desenvolvimento e aplicação de protocolo de DNA ambiental (e-DNA) como método rápido, preciso e não invasivo para o monitoramento da ictiofauna de água doce, BP.PIPE
• Assunto(s): Ictiofauna Recursos pesqueiros Licenciamento ambiental DNA ambiental Conservação Código de barras de DNA taxonômico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Conservação | DNA metabarcoding | recursos pesqueiros | DNA Ambiental

Resumo

Estudos de licenciamento ambiental em ambientes aquáticos são indissociáveis dos estudos da ictiofauna, principalmente em empreendimentos diretamente relacionados a esses ambientes, como usinas hidrelétricas e reservatórios. Contudo, técnicas tradicionais de amostragem de ictiofauna, como rede de espera, arrasto e peneira, são invasivas, levando muitas vezes ao óbito os indivíduos capturados. Além deste impacto sobre a ictiofauna, estas técnicas, por mais variadas que sejam, não garantem total eficácia de amostragem, sendo que, geralmente, espécies raras no ambiente ou recém-introduzidas, muitas vezes não são capturadas. A não detecção de espécies, principalmente as de baixa ocorrência, em processos de licenciamento, pode levar a tomadas de decisões e ações de manejo equivocadas, com prejuízo à ictiofauna e consequentemente ao equilíbrio ambiental. Diversas técnicas moleculares têm sido aplicadas aos estudos ecológicos, sendo o DNA barcode/metabarcode e o DNA ambiental (environmental DNA: e-DNA), consideradas ferramentas com potencial para sanar diversas dificuldades em estudos ambientais. O DNA ambiental consiste em obter, seja a partir da água ou sedimento, amostras de DNA dos organismos de interesse, sem a necessidade de contato com estes, evitando mortandades e aumentando a acurácia na identificação. Partindo desse pressuposto, o objetivo da Ictiológica Consultoria Ambiental é desenvolver e tornar aplicável um protocolo de DNA ambiental a ser utilizado em estudos de ictiofauna relacionados a processos de licenciamento no Brasil. O projeto foi dividido em três etapas, distribuídas entre as Fases I (etapa 1) e II (etapas 2 e 3) do PIPE. No PIPE fase I, foi estabelecida a técnica de extração, amplificação e sequenciamento de DNA proveniente de amostras de água e sedimento de tanques experimentais, com diferentes espécies e densidade numérica (etapa 1). O experimento em tanques visou a demonstração de viabilidade, bem como, a padronização da metodologia a ser empregada nas demais etapas. Na fase II do PIPE, será iniciada a etapa 2 do projeto que consistirá na aplicação do protocolo delineado em riachos da Cuesta de Botucatu, ambiente considerado de transição entre as fases de laboratório e ambiente natural, e na etapa 3, ocorrerá a aplicação da metodologia em rios e represas. Como resultado da Fase II, espera-se desenvolver um protocolo eficaz e replicável, em larga escala de uso, de DNA ambiental para estudos de ictiofauna de água doce, onde através de amostras de água ou sedimento, seja possível inferir quali-quantitativamente a ictiocenose local, substituindo as técnicas tradicionais existentes, melhorando a eficácia dos estudos e diminuindo a mortandade e impactos provenientes das técnicas tradicionais (AU)