EMU tecnológico: aquisição de um sistema de computação de alto desempenho para saúde e ciências da vida

• Processo: 22/11601-4
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Infraestrutura - Tecnologia e Inovação
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2023
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2030
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
• Pesquisador responsável: Sandra Coccuzzo Sampaio Vessoni
• Beneficiário: Sandra Coccuzzo Sampaio Vessoni
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Hugo Aguirre Armelin ; João Carlos Setubal ; Leo Kei Iwai ; Maria Carolina Quartim Barbosa Elias Sabbaga ; Paulo Lee Ho ; Sergio Verjovski Almeida
• Bolsa(s) vinculada(s): 24/11060-9 - Gerenciamento da InfraEstrutura HPC e Desenvolvimento de Aplicações para Portal Científico para Integração de Aplicações de Bioinformática no NBBC-HPC, BP.TT
• Assunto(s): Sistemas de computação Biologia computacional Biologia estrutural Ciência de dados Computação de alto desempenho Doenças transmissíveis Descoberta de drogas Ciências da vida Aquisição de equipamentos Equipamentos multiusuários Infraestrutura de pesquisa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Biologia Estrutural | Ciência de dados | Computacão de Alto Desempenho | descoberta de novas drogas | Doenças Infecciosas | Sistemas de Computação

Resumo

Nesse projeto reuniremos competências de diversos pesquisadores das áreas de Ciência da Saúde, Ciência Biológica e Ciência da Computação visando a área de Ciências da Vida e processamento de alto desempenho (HPC). O avanço das tecnologias moleculares e biotecnológicas, integrado aos desenvolvimentos em tecnologias mais recentes na área de Bioinformática e Biologia Computacional, tem aberto novas frentes para a criação de redes de monitoramento de variantes de patógenos como COVID-19, Influenza e Dengue. No estudos e simulações de modelos epidemiológicos para prevenção e acompanhamento de epidemias e pandemias. Na ampliação da integração de dados -ômicos, metagenômicos, clínicos, imunológicos e epidemiológicos para estudos de biologia de sistemas. Em análises evolutivas e de diversidade genética em patógenos, parasitas e organismos modelo e animais peçonhentos. Nosso principal objetivo é promover pesquisas em inovação tecnológica na área da Ciência da Saúde para elucidar a relação entre as taxas de diversificação genética e relação com ações de venenos, identificação de potenciais moléculas bioativas a partir do veneno de organismos venenosos, descoberta racional de novos fármacos e vacinas, e utilizar modelos de aprendizagem de máquina, inteligência artifical, bayesianos e teoria de grafos nos estudos para elucidar as vias moleculares e compostos bioquímicos subjacentes às doenças, entre outros fascinantes temas. Por meio da solução de computação de alta performance, proporemos novas soluções para o gerenciamento inteligente de recursos computacionais e novos sistemas de ambientes para ferramentas de Bioinformática e Biologia Computacional, proporcionando um salto quantitativo e qualitativo para novos desenvolvimentos. Disponibilizaremos novos ambientes integrativos com ferramentas para as análises de grandes volumes de dados, melhorando a usabilidade da infraestrutura por múltiplos e simultâneos usuaríos estabelecendo funcionalidades para otimização dos processos e qualidade dos resultados beneficinando os projetos vinculados a esta proposta, e servindo como base para novos projetos e colaborações em nível Estadual. Cada uma das linhas de pesquisa dos projetos envolvidos são coordenados por pesquisadores experientes de diferentes áreas e contribuirão por meio de colaborações, e estudantes utilizando a infraestrutura e desenvolvendo novas aplicações nas áreas de Boinformática, Biologia Computacional e Computação de Alto desempenho. O potencial desta solução se equipara e compete no mesmo patamar de estudos realizados em infraestruturas de HPC de Centros e Instituições de Pesquisa Internacionais. Deste modo, este projeto tem como metas fortalecer não só a pesquisa e desenvolvimentos em inovação tecnológica Institucional, já bem estabelecida e em ascenção, mas ampliar a sinergia entre acadêmicos e pesquisadores no Estado de São Paulo em prol da Inovação tecnológica em Saúde Pública. (AU)