Subsídios à avaliação do risco de extinção de vertebrados terrestres: o metabarcoding no apoio à tomada de decisão

• Processo: 25/02034-7
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2025
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2027
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Ecologia - Ecologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Marcio Roberto Costa Martins
• Beneficiário: Marcio Roberto Costa Martins
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Ana Paula Carmignotto ; Carla Martins Lopes ; Joyce Rodrigues Do Prado
• Assunto(s): Anfíbios Cerrado Conservação Mamíferos Répteis Conservação da biodiversidade
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Anfíbios | cerrado | Conservação | Mamíferos | Metabarcoding | Répteis | Conservação da Biodiversidade

Resumo

O Brasil tem o compromisso de avaliar o risco de extinção das cerca de 10.000 espécies de vertebrados, utilizando as diretrizes da IUCN para analisar a condição e a tendência das populações. A partir dessa avaliação, é elaborada a Lista Nacional de Espécies Ameaçadas de Extinção. Também são identificadas espécies cujas informações são insuficientes para uma avaliação precisa, que, portanto, tornam-se prioridades para a pesquisa em biodiversidade. No entanto, o monitoramento dessas espécies por meio de métodos tradicionais é dificultado, especialmente para aquelas que são de pequeno porte, raras ou de difícil detecção. Nesse cenário, o DNA ambiental (eDNA) metabarcoding, surge como uma abordagem inovadora, proporcionando a detecção de espécies raras e ameaçadas de maneira não invasiva. Embora o uso de eDNA em ambientes terrestres e abertos, como o cerrado, seja ainda pouco explorado, essa técnica apresenta grande potencial. Além disso, as bases de dados de sequências de DNA disponíveis ainda apresentam uma baixa representatividade de espécies neotropicais, limitando sua aplicação. Este projeto visa aprimorar o uso do eDNA metabarcoding para o registro de vertebrados terrestres raros, elusivos, ameaçados ou com dados insuficientes do cerrado do Planalto Central. Seus objetivos principais são: (1) ampliar a representatividade de genomas mitocondriais (mtDNA) de mamíferos brasileiros em bases públicas e (2) comparar a eficácia do eDNA metabarcoding com metodologias tradicionais de levantamento da herpetofauna e de pequenos mamíferos em ambientes savânicos. O projeto conta com o apoio do programa Genômica da Biodiversidade Brasileira (GBB), uma parceria entre o Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade (ICMBio) e o Instituto Tecnológico Vale (ITV), que será responsável pelo sequenciamento de genomas mitocondriais de espécies cujos tecidos estão depositados em coleções brasileiras. No entanto, algumas espécies ainda não possuem tecidos disponíveis e, para essas, o sequenciamento será realizado a partir de espécimes de coleções zoológicas, com o apoio do projeto "Amostra velha é que conta história boa" sob a responsabilidade de Joyce do Prado que apoiará o campo e a obtenção de DNA histórico (hDNA) de ossos, dentes ou fragmentos de pele. Este será o primeiro estudo a comparar a detectabilidade do eDNA metabarcoding com métodos tradicionais para o estudo da fauna de vertebrados no cerrado, criando uma oportunidade valiosa para o registro de espécies raras e ameaçadas nesse bioma. Neste estudo serão tomadas 90 amostras entre solo e água no Parque Nacional da Chapada dos Veadeiros, localizado no estado de Goiás, concomitante com uma coleta de 30 dias com armadilhas de interceptação e queda (pitfall) e armadilhas do tipo caixa e gaiola (sherman e tomahawk). Esperamos que o eDNA recupere um maior número de espécies e com maior representação das espécies ameaçadas e com dados insuficientes comparado com as metodologias tradicionais para répteis, anfíbios e mamíferos. (AU)