Caracterizacao molecular de cepas humanas de trypanosoma cruzi por microarranjos de dna.

• Processo: 03/06142-0
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2003
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2007
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Pesquisador responsável: Bianca Silvana Zingales
• Beneficiário: Bianca Silvana Zingales
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Trypanosoma Etiquetas de sequências expressas Genômica comparativa
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Doencas De Chagas | Ests | Expressao Diferencial De Genes | Genomica Comparativa | Microarranjos De Dna | Trypanosoma

Resumo

Este projeto tem como objetivo principal identificar marcadores genéticos de seis cepas de T. cruzi isoladas de pacientes com a forma indeterminada (n=3) e cardíaca (n=3) da doença de Chagas, utilizando a tecnologia de microarranjos de DNA. Nos microarranjos serão imobilizadas ESTs das formas epimastigota (n=800) e amastigota (n=1.200) de CL Brener, genes de cepas de T. cruzi (n=100) (já disponíveis) e ESTs (n=2.000) de amastigotas e/ou tripomastigotas de uma cepa humana (a serem determinadas no projeto). Os microarranjos serão empregados em estudos de genômica comparativa (hibridação DNA-DNA) e de expressão diferencial de genes (hibridação DNA-cDNA). Os alvos de hibridação diferencial serão identificados por agrupamentos hierárquicos, e comprovados por Southern e Northern blot. Experimentos-piloto com microarranjos de DNA já foram realizados, comprovando a potencialidade desta abordagem para o estudo proposto. Finalmente, pretendemos caracterizar a natureza híbrida de cinco isolados humanos a partir de genealogias de seqüências do DNA satélite de 195 pb. (AU)